Predicting Disease-related Genes Using Biomedical Literature Based on GloVe Word Embedding

Abstract

질병 관련 유전자를 식별하는 것은 질병 메커니즘을 이해하고 환자를 치료하는 데 필수적이다. 생물학적 실험은 시간과 비용이 많이 들기 때문에 텍스트 마이닝을 사용하는 연구의 수가 증가하고 있다. 본 연구는 GloVe기반으로 새로운 질병 관련 유전자를 예측하는 방법을 제안한다. 기존의 단어 임베딩 기반의 질병 연관유전자 추론 방법들은 단어 임베딩의 특성을 고려하지 않았기 때문에 실험을 재현하기 매우 어렵다. 하지만 제안된 방법은 반복 실험을 통하여 일정한 결과에 수렴하기 때문에 실험 재현이 가능하며 기존 방법보다 정확하다. 마지막으로, 제안된 방법은 기존 방법에 따라 예측되지 않은 유전자 중 질병과 관련성이 높은 유전자를 예측할 수 있으며 계속해서 업데이트 되는 유전자-질병 연관을 통하여 새로운 관계를 발견할 수 있다.