Abstract

Automated Vitek 2 system, based on comparison of a biochemical profile of the studied bacterial cultures with the existing database, is widely used for B. pseudomallei and B. mallei identification in the laboratory practice. Objective of the study is to conduct extended phenotypic characterization of the strains of glanders and melioidosis causative agents, stored in the biobank of the Volgograd Research Anti-Plague Institute and analyze variations in their biochemical profiles, using Vitek 2 system. Materials and methods. Using Vitek 2 device, (bioMerieux, France) analyzed have been biochemical properties of 52 collection strains of B. pseudomallei and B. mallei grown on L-agar (Difco, USA) and trypticase-soy agar – TSA (HiMedia, India). Results and discussion. Most of the investigated strains (31 out of 40 B. pseudomallei and 8 of 12 B. mallei) have been identified with an acceptable probability for determining certain specie appurtenance, amounting to 90–99 %. The percentage of correct identification of B. pseudomallei and B. mallei is higher when strains are cultured on L-agar, than when on TSA. Due to the variability of the biochemical features, some strains have showed non-typical for its species results in certain tests (for B. pseudomallei strains – the absence of enzyme activity of β-N-acetyl-glucosaminidase, β-N-acetyl-galactosaminidase and ability to utilize D-cellobiose; for B. mallei strains – the absence of enzyme activity of L-proline-aryl-amidase and tyrosin-aryl-amidase, existence of glycin-aryl-amidase activity and ability to utilize sucrose, D-trehalose), which has led to their mal-identification. The probability of error diagnostics of microorganisms belonging to Burkholderia species necessitates up-dating of the database built into Vitek 2 analyzer as regards biochemical characteristics of the strains which have peculiar profiles.

Highlights

  • Automated Vitek 2 system, based on comparison of a biochemical profile of the studied bacterial cultures with the existing database, is widely used for B. pseudomallei and B. mallei identification in the laboratory practice

  • Using Vitek 2 device, analyzed have been biochemical properties of 52 collection strains of B. pseudomallei and B. mallei grown on L-agar (Difco, USA) and trypticase-soy agar – TSA (HiMedia, India)

  • The percentage of correct identification of B. pseudomallei and B. mallei is higher when strains are cultured on L-agar, than when on TSA

Read more

Summary

Материалы и методы

В работе использованы 52 коллекционных штамма B. pseudomallei и B. mallei (табл. 1, 2). В работе использованы 52 коллекционных штамма B. pseudomallei и B. mallei Штаммы микроорганизмов выращивали на L-агаре (Difco, США) и триптиказо-соевом агаре – ТСА (HiMedia, Индия) при температуре 37 °С. Из 18-часовых культур готовили суспензию 0,5–0,63 плотности по МакФарланду согласно инструкции производителя bioMerieux для заполнения NG карт, предназначенных для автоматической идентификации клинически значимых ферментирующих и неферментирующих грамотрицательных палочек. Карты содержали 47 биохимических тестов с лиофилизированными биохимическими субстратами и необходимыми реагентами, позволяющими оценить утилизацию углеводов, ферментативную активность и устойчивость к ингибиторам. Лабораторный отчет содержал четкий окончательный ответ (единственный выбор) при степени соответствия биохимической активности идентифицируемой культуры профилю штамма-эталона на 85–99 %. Если биохимический профиль исследуемого образца не соответствовал ни одному из имеющихся в базе данных, лабораторный отчет системы содержал сообщение о невозможности идентификации. Время идентификации микроорганизмов не превышало 4–6 ч

Результаты и обсуждение
Нет данных
SAC dTRE
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
Full Text
Published version (Free)

Talk to us

Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have

Schedule a call