Abstract
Amplification of sea buckthorn Hippophae rhamnoides L. 5S rDNA nontranscribed spacer with coding border anneal primers showed existence of a single fragment. The fragment was cloned and sequenced. It was shown that length of the Hippophae rhamnoides L. 5S rDNA nontranscribed spacer is 807 bp. Analysis of the sequence allowed to detect a high homology with early described microsatellite locuses of Hippophae rhamnoides L., russian olive Elaeagnus angustifolia L., and Calligonum mongolicum Turcz. that include a (GA)9 motif. These results may be useful to study a ribosomal RNA gene organization.
Highlights
Центр молекулярной биотехнологии, Российский государственный аграрный университет — Московская сельскохозяйственная академия имени К.А
It was shown that length of the Hippophae rhamnoides L
Analysis of the sequence allowed to detect a high homology with early described microsatellite locuses of Hippophae rhamnoides L
Summary
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ НЕТРАНСКРИБИРУЕМОГО СПЕЙСЕРА 5S-рДНК У HIPPOPHAE RHAMNOIDES L. Амплификация нетранскрибируемого спейсера 5S-рДНК облепихи крушиновидной (Hippophae rhamnoides L.) с помощью праймеров, подобранных на фланги соседних кодирующих областей, показала наличие единичного фрагмента. Что длина нетраскрибируемого спейсера облепихи составляет 807 п.о. Ключевые слова: 5S-рДНК, нетраскрибируемый спейсер, микросателлитный локус, Hippophae rhamnoides L., Elaeagnus angustifolia L., Calligonum mongolicum Turcz. Полиморфизм NTS 5S-рДНК используют для филогенетических исследований, анализа гибридов и разработки видоспецифичных маркеров [7, 8]. Что кодирующие участки кластеров 5S-рДНК консервативны, можно провести амплификацию NTS у широкого круга видов с помощью одной и той же пары праймеров, подобранной на фланги генов (рисунок). Также предпринимались попытки использования RAPD и других видов молекулярных маркёров для изучения полиморфизма облепихи [11]. Данная работа является первым сообщением о последовательности NTS 5S-рДНК облепихи
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Disclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.