Abstract
This study aimed to develop an algorithm for downloading and preprocessing microdata furnished by the Brazilian Health Informatics Department (DATASUS) for various health information systems, using the R statistical programming language. The package allows downloading and preprocessing data from various health information systems, with the inclusion of labeling categorical fields in the files. The download function was capable of directly accessing and reducing the workload for the selection of microdata files and variables in DATASUS, while the preprocessing function enabled automatic coding of various categorical fields. The package thus enables a continuous workflow in the same program, in which the algorithm allows downloading and preprocessing and other packages in R allow analyzing data from the health information systems in the Brazilian Unified National Health System (SUS).
Highlights
This study aimed to develop an algorithm for downloading and preprocessing microdata furnished by the Brazilian Health Informatics Department (DATASUS) for various health information systems, using the R statistical programming language
Cad Saúde Colet (Rio J.) 2010; 18:7-18
Summary
O objetivo do estudo foi desenvolver um algoritmo capaz de realizar o download e o pré-processamento de microdados fornecidos pelo Departamento de Informática do SUS (DATASUS) para diversos sistemas de informações em saúde para a linguagem de programação estatística R. O pacote desenvolvido permite o download e o pré-processamento de dados de diversos sistemas de informação em saúde, com a inclusão da rotulagem dos campos categóricos nos arquivos. Dessa forma, a utilização desse pacote possibilita um fluxo de trabalho contínuo no mesmo programa, no qual esse algoritmo permite o download e o pré-processamento, e outros pacotes do R permitem a análise de dados dos sistemas de informação em saúde do Sistema Único de Saúde (SUS). Como alternativa à interface ao TabWin e superando algumas de suas limitações, este trabalho desenvolveu e disponibilizou um pacote para o programa estatístico R (http://www.r-project.org), com funções de download e pré-processamento de microdados do DATASUS. Ele oferece funções para o download e o pré-processamento de microdados disponibilizados pelo DATASUS
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