Local experience of real-time PCR implementation into microbiological monitoring programs

Tatiana A Zykova,O.I Kit,D.S Petrov,O.A Bogomolova,A.A Maslov,M.N Duritskiy

doi:10.36488/cmac.2018.3.244-248

Abstract

Objective. To study level and structure of microbial colonization in cancer patients before admission to a surgery department using molecular methods. Materials and Methods. The presence of DNA of methicillin-resistant Staphylococcus aureus, methicillinresistant coagulase-negative staphylococci, Candida albicans/C. glabrata/C. krusei, Acinetobacter baumannii in the clinical specimens and the presence of antimicrobial resistance genes in cultures were detected by multiplex real-time PCR. A total of 741 clinical samples and 313 cultures were studied. Results. The high level of microbial colonization, including microorganisms with antibiotic resistance genes, was found in cancer patients. Methicillin-resistant staphylococci, A. baumannii and Candida spp. were detected in 56.6%, 20% and 24.8% of cancer patients, respectively. Of patients infected with A. baumannii, 35.9% had OXA-carbapenemase genes. A. baumannii producing blaOXA40 was the most common cause of infectious complications. Conclusions. Molecular methods can be used effectively not only for the diagnosis of infectious diseases, but also in microbiological monitoring programs.

Highlights

Methicillin-resistant staphylococci, A. baumannii and Candida spp. were detected in 56.6%, 20% and 24.8% of cancer patients, respectively
В то же время, несмотря на широкое внедрение в работу микробиологических лабораторий новых авто матизированных систем для идентификации и определе ния чувствительности микроорганизмов, классические культуральные методы не всегда бывают достаточно чувствительными
В то же время известно, что подобный скрининг является неотъемлемой частью программ снижения MRSA-инфек ций

Summary

ОПЫТ РАБОТЫ

Локальный опыт интеграции ПЦР в режиме реального времени в программы микробиологического мониторинга (на примере стационара онкологического профиля). Ключевые слова: молекулярные методы, ПЦР в режиме реального времени, микробиологический мониторинг, колонизация. Изучить уровень и структуру микробной колонизации у онкологических больных до поступле ния на хирургическое лечение с использованием молекулярных методов. Методом мультиплексной ПЦР в режиме реального времени был исследо ван клинический материал на наличие ДНК метициллинорезистентного Staphylococcus aureus, мети циллинорезистентных коагулазонегативных стафилококков, Candida albicans/C. glabrata/C. krusei, Acinetobacter baumannii и культуры микроорганизмов на наличие генетических детерминант анти биотикорезистентности. Установлен высокий уровень колонизации онкологических больных микроорганизмами, имеющими гены, кодирующие продукцию бета-лактамаз. Уже при поступлении в стационар 56,6% онкологических больных были колонизированы метициллинорезистентными стафилококками, 20% – A. baumannii, 24,8% – Candida spp. Что молекулярные методы могут эффективно использоваться не только для диагностики инфекционных заболеваний, но и в программах микробиологического мониторинга.

Objective

Материалы и методы

Результаты и обсуждение

Findings

Всего с геном mecA абс