Investigation of symptom types and viral proteins produced by Beet necrotic yellow vein virus isolates on the model plant Nicotiana benthamiana

Abstract

Beet necrotic yellow vein virus (BNYVV), dünyada şeker pancarı alanlarında ‘rhizomania’ olarak adlandırılan hastalığa neden olmaktadır. Bu çalışmada, Türkiye’nin farklı coğrafik bölgelerinde şeker pancarı üretim alanlarından elde edilmiş BNYVV ile bulaşık olduğu bilinen 15 toprak örneği kullanılmıştır. Öncelikle, tuzak bitki testi yöntemine göre BNYVV izolatlarının yeniden çoğaltımı sağlanmıştır. Daha sonra, 15 BNYVV izolatı virüsün sistemik konukçusu Nicotiana benthamiana’ya mekanik olarak inokule edilmiştir. Şiddetli (cücelik ve mozayik) ya da zayıf (mozayik) simptom oluşumu gösteren bitkilerin sistemik yapraklarından RNA izolasyonunu takiben, gen spesifik primerler kullanılarak RT-PCR çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Bu çalışmalar sonucunda; 15 BNYVV izolatı ile enfekteli N. benthamiana’da P31 ile ilgili gen bölgesi saptanmasına ragmen, kılıf protein bölgesi 10 izolatta, P25 bölgesi bir izolatta, P26 bölgesi ise dört izolatta belirlenmiştir. Bu sonuç, N. benthamina’da BNYVV’nin simptom oluşumunda P31 geninin rol oynadığını desteklemiş, P25 ve P26 gen bölgelerinin ise bazı izolatlarda virüsün replikasyonu esnasında tespit edilemediğini göstermiştir.