Abstract

Estudos de simulação foram conduzidos com o objetivo de verificar a influência da informação a priori nas avaliações genéticas dos animais. Foi simulado um genoma de 3.000 centimorgans, considerando-se uma única característica quantitativa, determinada por 800 locos, com dois alelos por loco, na qual a herdabilidade variou de 0,40 a 0,60. Foram simulados 1.500 machos e 1.500 fêmeas, que formaram a população-base. A partir da população-base, foram formados três tamanhos de populações: POP1 (100 animais), POP2 (300 animais) e POP3 (1.600 animais). Foram empregados três níveis de informação a priori: priors não-informativos (PNI), priors pouco informativos (PPI) e priors informativos (PI). Foram avaliadas também as conseqüências de se incluir nas análises valores de priors superestimados (com 50% de erro), considerados pouco informativos e informativos. Para verificação da influência de diferentes níveis de informação na avaliação genética, foram utilizadas a Porcentagem de Erro em relação ao valor verdadeiro dos componentes de variância, a Correlação de Spearman e o Quadrado Médio do Erro entre os valores genéticos reais e os preditos. As populações POP1 e POP2 apresentaram maiores porcentagens de erro e foram mais sensíveis às informações a priori. Maiores níveis de informação conduziram a melhores estimativas das variâncias, sendo que os QME apresentaram-se menores com o aumento do nível de informação, principalmente para as populações pequenas. Entretanto, as Correlações de Spearman permaneceram sempre inferiores a 0,70 para POP1 e POP2, indicando grandes alterações nas classificações dos animais. Conclui-se que existe uma perda ao se trabalhar com conjuntos de dados pequenos, mesmo quando informações a priori adicionais estão disponíveis.

Highlights

  • The influence of a priori information on animal genetic evaluation was studied using a simulated 3.000 centimorgans genome, for a single trait governed by 800 loci, with two alleles for locus, and heritability varying from 0.40 to 0.60

  • Os objetivos neste trabalho foram verificar a influência da informação a priori na avaliação genética animal, utilizando inferência Bayesiana, em populações simuladas com diferentes tamanhos, e avaliar o efeito de se assumirem valores inadequados de priors nos componentes de variâncias genética e residual e na predição dos valores genéticos

  • A partir das porcentagens de erro entre os componentes de variâncias verdadeiros e os estimados, foi possível verificar o efeito dos diferentes níveis de informação a priori em populações com diferentes tamanhos

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Summary

Influence of Prior Information in Animal Genetic Evaluation Using Simulated Data

ABSTRACT - The influence of a priori information on animal genetic evaluation was studied using a simulated 3.000 centimorgans genome, for a single trait governed by 800 loci, with two alleles for locus, and heritability varying from 0.40 to 0.60. Os autores observaram que as estimativas foram mais precisas quando maiores níveis de informação a priori foram utilizados, demonstrando que a análise Bayesiana pode ser empregada para incorporar informações externas em uma situação prática de melhoramento animal. Rodrigues et al (1996), trabalhando com dados reais de suínos Landrace, utilizaram dois níveis de informação a priori: priors não-informativos (flat priors), refletindo pouco conhecimento sobre os componentes de variância e priors informativos. Os objetivos neste trabalho foram verificar a influência da informação a priori na avaliação genética animal, utilizando inferência Bayesiana, em populações simuladas com diferentes tamanhos, e avaliar o efeito de se assumirem valores inadequados de priors nos componentes de variâncias genética e residual e na predição dos valores genéticos

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