Abstract

We identified a species level of the fungal cultures isolated from selected crop seeds using traditional method and BIO-PCR. The use of BIO-PCR did not correspond completely to the morphological analyses. Both methods showed increased infection with <i>F. poae</i> in winter wheat seed sample originated from north Poland. Fungal culture No 40 (isolated from faba bean and identified with traditional method as mixed culture with <i>F. culmorum</i> and <i>F. graminearum</i>) did not produce expected product after PCR reaction with species specific primers OPT18F<sub>470</sub>, OPT18R<sub>470</sub>. However, the use of additional primers Fc01F, Fc01R allowed for reliable identification of <i>F. culmorum</i> in the culture.

Highlights

  • Summary We identified a species level of the fungal cultures isolated from selected crop seeds using traditional method and BIO-PCR

  • The use of BIO-PCR did not correspond completely to the morphological analyses. Both methods showed increased infection with F. poae in winter wheat seed sample originated from north Poland

  • Fungal culture No 40 did not produce expected product after PCR reaction with species specific primers OPT18F470, OPT18R470 the use of additional primers Fc01F, Fc01R allowed for reliable identification of F. culmorum in the culture

Read more

Summary

WSTĘP I CEL PRACY

Grzyby z rodzaju Fusarium reprezentują liczną grupę gatunków stanowiących poważne zagrożenie dla roślin uprawnych na całym świecie. W Polsce do najgroźniejszych patogenów z rodzaju Fusarium zalicza się: F. avenaceum, F. culmorum, F. graminearum, F. poae, F. oxysporum i F. solani Znalazły metody oparte na reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR). W metodzie tej następuje amplifikacja w reakcji PCR DNA pochodzącego z żywych komórek patogena. Szczególne zastosowanie w identyfikacji grzybów z rodzaju Fusarium znalazły markery SCARs W metodzie SCARs zachodzi amplifikacja w reakcji PCR tylko jednego, określonego gatunkowo fragmentu DNA patogena grzybowego. Obecnie wyżej wymienione markery zostały już opracowane dla większości gatunków z rodzaju Fusarium, ważnych z gospodarczego punktu widzenia. Celem niniejszej pracy była identyfikacja Fusarium avenaceum, Fusarium culmorum, Fusarium graminearum i Fusarium poae z nasion wybranych gatunków roślin uprawnych metodą tradycyjną i BIO-PCR

MATERIAŁ I METODY
Przygotowanie prób
Reakcja PCR
Warunki reakcji PCR PCR reaction conditions
Elektroforeza i wizualizacja produktu reakcji PCR w świetle UV
Tradycyjna metoda identyfikacji grzybów z rodzaju Fusarium
Fusarium poae
Fusarium tricinctum
Analizy PCR z użyciem specyficznych primerów SCARs
Full Text
Published version (Free)

Talk to us

Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have

Schedule a call