Abstract

A moderately halophilic actinomycete strain was isolated from marine sediments collected at the Marakkanam coast of Tamil Nadu, India. The taxonomic position was evaluated by polyphasic approach and the strain was identified as a member of the genus Streptomyces. The strain is congruent with the description of the genus Streptomyces due to the characteristics of white aerial cell mass, spiral spore chains and a rough spore surface, menaquinones of MK-9 (H4, H2 and H6) types and belongs to cell-wall type I. The G + C content of the isolated DNA is 71.3 mol% and the 16S rRNA sequence of the strain shows a maximum of 93% similarity with Streptomyces HBUM 49447. The comparison of phenotypic data of closest strains with the isolate clearly indicates that our strain belongs to the genus Streptomyces. Based on the phenotypic and phylogenetic analysis, the strain was classified as a new species of the genus Streptomyces and designated as VITSDK1. The media and cultural conditions for maximal growth have been optimized under shake-flask conditions by measuring the dry weight of the mycelium. The maximal growth was attained with the use of optimized production medium, pH of 7.2 and incubation temperature of 27 °C. The growth of the strain was salt concentration dependent and maximal growth was attained at 15% salt concentration which indicates the halophilic nature of the isolate. Streptomyces VITSDK1 spp. exhibits significant hemolytic activity against rat erythrocytes with the EC50 value of 127 μg/ml and for human erythrocytes 168 μg/ml. Further, it shows moderate antibiosis against fungi and bacterial pathogens. Une souche d’actinomycète modérément halophile a été isolée de sédiments marins récoltés sur la côte de Marakkanam du Tamil Nadu à l’est de l’Inde. La souche a été identifiée comme appartenant au genre Streptomyces. Elle est conforme à la description du genre Streptomyces par ses caractéristiques de culture, ses chaînes spiralées de spores à paroi rugueuse, ses ménaquinones MK-9 (H2, H4 et H6) et son appartenance à la paroi de type I. Le G + C de l’ADN isolé est de 73 % et la séquence du 16S ARN montre un maximum de similarité de 93 % avec la souche de Streptomyces HBUM 49447. La comparaison des travaux sur le phénotype de souches proches avec la souche isolée montre clairement qu’elle appartient au genre Streptomyces. Compte tenu de l’analyse phénotypique et génotypique, elle a été identifiée comme une nouvelle souche du genre Streptomyces et dénommée VITSDK1. Les milieux et les conditions de culture pour une croissance maximale ont été optimisés en culture en ballons agités par la mesure du poids sec du mycélium. Le maximum de culture est atteint à l’aide d’un milieu optimisé, à pH 7,2 et à température de 27 °C. La croissance de la souche est concentration dépendante en sel et la croissance maximale est obtenue pour 15 % de concentration saline qui montre l’halophilie de cette souche. Streptomyces VITSDK1 sp. montre une activité hémolytique significative contre les érythrocytes de souris et les érythrocytes humains avec une EC50 respectivement de 127 et 168 μg/ml. Par ailleurs, elle montre une activité antimicrobienne modérée contre des champignons et des bactéries pathogènes.

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