Gibbs Sampler를 이용한 돼지 주요 경제형질의 유전모수 추정

Abstract

본 연구는 1998년부터 2006년까지 축산과학원에서 능력검정을 실시한 Duroc종 산육능력 검정자료 3,526두와 혈통자료 3,910두의 자료를 이용하여 30kg시 일당증체량, 90kg시 일당증체량, 평균 등지방두께, 90kg 도달일령 및 사료요구율에 대한 유전모수를 추정하기 위하여 실시하였다. 검정기록을 바탕으로 유전모수의 추정은 단형질 및 다형질 혼합모형을 이용하여 Gibbs sampling을 이용한 Bayesian 방법을 이용하였다. 듀록 종의 산육능력 검정자료를 바탕으로 분산분석을 실시한 결과 모든 조사형질에 대하여 성별, 연도, 계절에 있어서 고도의 유의성을 보였으며, 단형질 Bayesian 방법에 의해 추정한 Post-gibbs 후의 30kg 도달시 일당증체량, 30kg~90kg 도달시 일당증체량, 등지방두께, 90kg 도달일령 및 사료요구율의 유전력은 각각 0.43, 0.49, 0.31, 0.48 및 0.62로 추정되었다. 또한 다형질 Bayesian 방법에 의해 추정한 형질간 유전상관은 30kg 도달시 일당증체량과 30kg~90kg 도달시 일당증체량, 등지방두께, 90kg 도달일령, 사료요구율에서는 각각 －0.02, －0.13, －0.55 및 －0.15로 추정되었으며, 30kg~90kg 도달시 일당증체량과 등지방두께, 90kg 도달일령, 사료요구율간의 유전상관은 각각 0.16, －0.73, －0.32로 추정되었고, 등지방두께와 90kg 도달일령, 사료요구율에서는 각각 0.01 및 －0.08로 추정되었으며, 90kg 도달일령과 사료요구율간의 유전상관은 0.23으로 추정되었다. Heritability and genetic correlation for growth traits in Duroc pig breed were estimated using Bayesian method via Gibbs sampling. The data set consisted of 3,526 performance records at National Institute of Animal Science. For estimating those parameters using Gibbs sampling, 5,000 cycles of ‘burn-in’ period were discarded among a total of 55,000 samples. Out of the remaining 50,000 samples, 5,000 estimates by each parameter were retained and used for analyses to avoid any correlation among adjacent samples. The growth traits considered in this study were average daily gain at 30kg(ADG1), average daily gain at 90kg(ADG2), backfat thickness(BF), days to 90kg(D90) and feed conversion ratio(FC). The estimated heritabilities and their standard deviation using Gibbs sampler were 0.43±0.04, 0.49±0.038, 0.31±0.040, 0.48±0.039 and 0.62±0.086, respectively. Genetic correlations were －0.02, －0.13, －0.55 and －0.15 between ADG1 with ADG2, BF, D90 and FC, respectively, 0.16, －0.73, －0.32 between ADG2 with BF, D90 and FC respectively, 0.01, －0.08 between BF with D90, FC, respectively, and 0.23 between D90 with FC.