Abstract
Objective. To determine species, sequence-types, antimicrobial resistance and virulence genes in Achromobacter spp. isolates obtained from cystic fibrosis (CF) patients in Russia. Materials and Methods. Samples (sputum, nasopharyngeal swab) from 168 CF patients from 48 regions were studied. Whole-genome sequencing (WGS) was performed on MGISEQ-2000 platform. SPAdes software, Galaxy, ResFinder, Integrall, PubMLST were used for analysis of WGS data. Results. A total of 18 strains of Achromobacter spp. were isolated from 16 of 168 CF patients.Achromobacter xylosoxidans was the most prevalent and detected in 13⁄18 cases (72%). Studied Achromobacter spp. isolates belonged to 14 sequence types, including 8 new sequence types. An adaptive resistance gene carriage was a rare phenomenon (1⁄18 isolates). Conclusions. The Achromobacter spp. colonization rate of respiratory system in CF patients in Russia corresponds to the data reported in other countries. A. xylosoxidans isolates were the most prevalent (72%). Achromobacter spp. isolates from CF patients in Russia and show a high clonal diversity.
Highlights
Межрегиональная ассоци ация по клинической микро биологии и антимикробной химиотерапии Научно-исследовательский ин ститут антимикробной химио терапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России
Sequence-types, antimicrobial resistance and virulence genes in Achromobacter spp. isolates obtained from cystic fibrosis (CF) patients in Russia
The Achromobacter spp. colonization rate of respiratory system in CF patients in Russia corresponds to the data reported in other countries
Summary
Бочарова Ю.А., Савинова Т.А., Чаплин А.В., Лямин А.В., Кондратенко О.В., Поликарпова С.В., Жилина С.В., Федорова Н.И., Коржанова М., Маянский Н.А., Чеботарь И.В. 220 Геномные характеристики штаммов Achromobacter spp., выделенных от пациентов с муковисцидозом в России. Бочарова Ю.А., Савинова Т.А., Чаплин А.В., Лямин А.В., Кондратенко О.В., Поликарпова С.В., Жилина С.В., Федорова Н.И., Коржанова М., Маянский Н.А., Чеботарь И.В. 220 Геномные характеристики штаммов Achromobacter spp., выделенных от пациентов с муковисцидозом в России. 226 Мукормикоз: современные возможности диагностики и лечения, существующие проблемы и новые тенденции в терапии. 248 Почти два года с COVID-19: некоторые аспекты использования антибиотиков. Хостелиди С.Н., Зайцев В.А., Пелих Е.В., Яшина Е.Ю., Родионова О.Н.,Богомолова Т.С., Авдеенко Ю.Л., Климко Н.Н. 255 Мукормикоз на фоне COVID-19: описание клинического случая и обзор литературы Хостелиди С.Н., Зайцев В.А., Пелих Е.В., Яшина Е.Ю., Родионова О.Н.,Богомолова Т.С., Авдеенко Ю.Л., Климко Н.Н. 255 Мукормикоз на фоне COVID-19: описание клинического случая и обзор литературы
Sign-in/Register to view highlights & summary Sign-in/Register to access full text options 
Free) 
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Schedule a call
