Abstract
87 isolates of M. tuberculosis isolated from tuberculosis patients in the Novouralsk municipality in 2013-2016 were studied. It was found out that a high percentage of isolates had multiple drug resistance: 66 and 85.3% among newly diagnosed and previously treated patients, respectively. Genotyping allowed revealing the dominance of isolates of the Beijing family, both among newly diagnosed (75.5%) and previously treated patients (85.3%), with 52.8 and 67.6% of isolates, respectively, belonging to the Beijing B0/W148 variant. MIRU-VNTR-typing detected nine isolates of the Beijing B0/W148 family with an atypical number of repeats in the QUB26 locus (two). A high rate of tuberculosis with concurrent HIV (39.1%) was noted, while in groups of tuberculosis patients with various HIV statuses, no difference was detected in the ratio of multiple drug resistant pathogens and belonging to the Beijing genotype (BeijingB0/W148). The article demonstrates the possibility of using genotyping technologies to confirm/deny the epidemiological relationship between patients and search for previously unknown mechanisms of tuberculosis infection transmission.
Highlights
ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПОЛИМОРФИЗМ ВОЗБУДИТЕЛЯ ТУБЕРКУЛЕЗА НА ТЕРРИТОРИИ ГОРОДА С ОГРАНИЧЕННОЙ МИГРАЦИЕЙ НАСЕЛЕНИЯ И ВЫСОКИМ УРОВНЕМ ЗАБОЛЕВАЕМОСТИ ВИЧ-ИНФЕКЦИЕЙ
Материалы для государственного доклада «О состоянии санитарноэпидемиологического благополучия населения Новоуральского городского округа в 2017 году» [Электронный ресурс] // fmbaros.ru-2018 URL: http://fmbaros.ru/Public/Ru/mru31/sancondition
А. Биологические свойства и эпидемиологическая значимость Mycobacterium tuberculosis, выделенных от больных с сочетанной патологией (туберкулез/ВИЧ): Дис
Summary
В 2013-2016 гг. в лаборатории микробиологии и ПЦР-диагностики Уральского НИИ фтизиопульмонологии (филиал ФГБУ «НМИЦ ФПИ» Минздрава России) был выделен 181 изолят M. tuberculosis от 118 больных туберкулезом жителей Новоуральского городского округа. В исследование было включено 87 образцов – впервые полученные изоляты от 87 пациентов, у которых были известны данные из историй болезни. Согласно данным из историй болезни, 34 (39,1%) пациента выборки были ВИЧ-позитивными. По 1 мл суспензии микобактерий, оставшейся после постановки теста на лекарственную чувствительность, в течение 2013-2016 гг. Выделение ДНК проводили из размороженной суспензии микобактерий с использованием набора реагентов «Экспресс-туб» Принадлежность к генотипу Beijing определяли тест-системой «Амплитуб-Beijing» (НПК Синтол, Москва), принадлежность к кластеру Beijing B0/W148 ‒ мультиплексной ПЦР. Все изоляты генотипа Beijing были дополнительно генотипированы по двум наиболее полиморфным для этой генетической группы локусам: MIRU26, QUB26. Принадлежащие к другим генетическим линиям (non-Beijing), были генотипированы и классифицированы с использованием набора «Сполигочип» Для девяти изолятов выявляли мутации устойчивости к противотуберкулезным препаратам с использованием тест-системы «ТБ-ТЕСТ» Статистический анализ проводили с использованием таблиц сопряженности и критерия хи-квадрат (χ2); статистически значимыми считали различия при p < 0,05
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Disclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.