Abstract
Objective. To analyze the genetic structure of rotaviruses of group A, circulating on the territory of the Orenburg region in different epidemic seasons.Materials and methods: The genetic structure of rotaviruses by G/P alleles was determined in 341 fecal samples of patients with gastroenteritis clinic under the age of 5 years in various epidemic seasons. ELISA and PCR methods were used. The typing of rotaviruses was conducted on the basis of the laboratory of molecular diagnostic and epidemiology of enteric infections of the Department molecular diagnostics Central research Institute of epidemiology.Results: The general genetic structure of group a rotaviruses circulating in the Orenburg region in the period from 2014—2020 was determined, expressed, by the frequencies of G/P alleles. The genetic potential of group a rotaviruses for the entire study period was represented by twelve variants of genotypes for G/P alleles, the leading role in the epidemic process was played by genotypes with the highest frequency of occurrence: G4[P]8, G9[P]8, G2[P]4, Mixt. The frequency of registration of combined forms of various rotavirus genotypes (Mixed forms) was 5,9%.Conclusion: The main and dominant genotypes, their regional diversity and inter-seasonal fluctuations are established. The spectrum of circulating rotavirus genotypes differed in different epidemic seasons, and their epidemic significance is shown.
Highlights
P alleles was determined in 341 fecal samples of patients
The typing of rotaviruses was conducted on the basis of the laboratory
The general genetic structure of group a rotaviruses circulating in the Orenburg region in the period
Summary
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РОТАВИРУСОВ ГРУППЫ А, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ В ОРЕНБУРГСКОМ РЕГИОНЕ В РАЗНЫЕ ЭПИДЕМИЧЕСКИЕ СЕЗОНЫ. Резюме Цель: проанализировать генетическую структуру ротавирусов группы А, циркулирующих на территории Оренбургского региона в разные эпидемические сезоны. Материалы и методы: генетическая структура ротавирусов по аллелям G/P определена в 341 образце фекалий пациентов с клиникой гастроэнтерита в возрасте до 5 лет в различные эпидемические сезоны. Результаты: определена общая генетическая структура ротавирусов группы А, циркулирующих в Оренбургской области в период 2014–2020 гг., выраженная частотами аллелей G/Р. Генетический потенциал ротавирусов группы А за весь период исследования был представлен 12 вариантами генотипов по G/P аллелям, ведущее значение в эпидемическом процессе имели генотипы с наиболее высокой частотой встречаемости: G4[P]8, G9[P]8, G2[P]4, Mixt. Частота регистрации сочетанных форм различных генотипов ротавирусов (Mixtформы) составила 5,9%. Спектр циркулирующих генотипов ротавирусов отличался в различные эпидемические сезоны, показана их эпидемическая значимость.
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have