Evaluation of Mammalian Interspersed Repeats to investigate the goat genome

Abstract

RiassuntoValutazione di sequenze intersperse ripetute per l’analisi del genoma caprino. Tra le classi di sequenze intersperse ripetute, le Mammalian Interspersed Reapeats (MIR) sono utilizzate per la definizione di relazioni filogenetiche tra diversi gruppi tassonomici. Analizzando un ristretto numero di individui non imparentati, appartenenti a 7 diverse razze caprine italiane, é stata valutata la presenza di polimorfismi interspecie per questa classe di sequenze. I risultati ottenuti indicano che il 66% dei marcatori, prodotti amplificando sequenze inter-MIR, sono polimorfici tra le razze analizzate. Il calcolo dei valori di eterozigosi attesa entro e tra razze ed il valore di Fst indica che, nel campione da noi considerato, la variabilità genetica osservata é legata a differenze tra razze e corrisponde al 35,5% della variabilità genetica totale. Questi dati suggeriscono il possibile utilizzo delle MIR in studi di diversità genetica, completando il quadro delle informazioni già disponibili per geni, mtDNA e marcatori neutri.