Abstract

This review is devoted to the European subtype of tick-borne encephalitis virus (TBEV). It summarizes and analyzes the information available at the scientific literature on the genetic and biological properties of strains of this virus subtype. A comparative analysis of the complete coding sequences of all currently recognized tick-borne flaviviruses was carried out. It was noted that the differences in TBEV strains included in the European subtype are minimal, which indicates a higher degree of their genetic homogeneity than in strains of the Far Eastern and Siberian subtypes. The level of differences in the genome of strains of the European subtype, depending on the region and the source of isolation, was analyzed. No relationship was found between the level of homology of nucleotide sequences of TBEV strains of the European subtype and the source of isolation. The proposed models for the evolution of TBE are described. The area of TBE of the European subtype in Eurasia is analyzed. The maps of the geographical distribution of the European subtype are presented. It shows the European subtype TBE is found in 14 regions of Russia. TBE of this subtype, as a rule, causes a disease with a milder course in comparison with TBE caused by a virus of the Far Eastern or Siberian subtypes. An analysis of the main vectors and reservoir hosts of the European subtype TBEV in Europe and in Siberia has been carried out. It is emphasized that in Eurasia the European TBEV circulates in territories that differ significantly in climatic conditions, relief, landscape, and characteristics of biotopes. However, analysis of scientific literature data showed that, despite these differences, it has a high degree of genome stability.

Highlights

  • Вирус клещевого энцефалита (ВКЭ) принадлежит к роду Flavivirus семейства Flaviviridae

  • При сравнении как кодирующей области генома, так и соответствующей ей последовательности полипротеина среди групп штаммов трёх основных субтипов различия у штаммов tick-borne encephalitis virus (TBEV)-Eur были минимальными, что свидетельствует о более высокой степени их генетической однородности, чем у штаммов Дальневосточного и Сибирского субтипов

  • Что предок TBEV-Eur разошёлся с общим предком остальных субтипов TBEV приблизительно 1087 лет назад (95%-й доверительный интервал (ДИ): от 649 до 1610 лет)

Read more

Summary

МИКРОБИОЛОГИЯ И ВИРУСОЛОГИЯ MICROBIOLOGY AND VIROLOGY

Представленный обзор посвящён европейскому субтипу вируса клещевого энцефалита (ВКЭ). Проведён сравнительный анализ полных кодирующих последовательностей всех признанных на сегодняшний день клещевых флавивирусов, в том числе и штаммов трёх основных субтипов ВКЭ, имеющихся в базе данных GenBank. Что различия у штаммов ВКЭ, входящих в состав европейского субтипа, являются минимальными, что свидетельствует о более высокой степени их генетической однородности, чем у штаммов дальневосточного и сибирского субтипов. Осуществлён анализ уровня различий генома штаммов европейского субтипа в зависимости от региона и источника изоляции. Проанализирован ареал ВКЭ европейского субтипа на территории Евразии. Проведён сравнительный анализ основных переносчиков и резервуарных хозяев ВКЭ европейского субтипа в Европе и в Западной и Восточной Сибири. Однако анализ данных научной литературы показал, что, несмотря на эти различия, он обладает высокой степенью стабильности генома. Статья поступила: 15.01.2021 Статья принята: 20.08.2021 Статья опубликована: 12.10.2021

АНТИГЕННЫЕ СВОЙСТВА
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ШТАММОВ ВКЭ ЕВРОПЕЙСКОГО СУБТИПА
Различия по последовательности полипротеина
ЭВОЛЮЦИОННАЯ ИСТОРИЯ
КЛИНИЧЕСКОЕ ТЕЧЕНИЕ
ПЕРЕНОСЧИКИ И РЕЗЕРВУАРНЫЕ ХОЗЯЕВА
Findings
КЛИМАТОГЕОГРАФИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ
Full Text
Published version (Free)

Talk to us

Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have

Schedule a call