Etiological role and molecular-genetic features of &lt;i&gt;Streptococcus pneumoniae&lt;/i&gt; in children’s infectious diseases

I N Protasova,G P Martynova,E S Sokolovskaya,I A Kutischeva,N A Ilyenkova,O P Ovchinnikova,S V Domracheva

doi:10.22627/2072-8107-2020-19-1-7-12

Abstract

Objective: To study the etiological role, serotype distribution and prevalent Streptococcus pneumoniae genotypes (sequence types) in 459 children hospitalized with acute purulent otitis media, acute tonsillitis, community-acquired pneumonia, and purulent bacterial meningitis. Pneumococcal cultures isolated from patients were tested for sensitivity to antimicrobials, and presence of resistance genes. Materials and Methods: The cultural and molecular methods (PCR, sequencing) were used. Statistical analysis was carried out using Microsoft Excel 2007 and Statistica 6.0. Results: S. pneumoniae was detected in 16,8%. The prevalent serotypes were 19F (39.7%) and 19A (13.2%) — representatives of multidrug-resistant clonal com-plex 320. Isolates of serogroup 6 (6AB, 8.82%) belonged to clonal complex 315, and characterized by resistance to macrolides, clindamycin and tetracycline. From 70.6% to 88.2% of S. pneumoniae serotypes isolated from patients corresponded to «vaccine»-types.

Highlights

Цель: выявление этиологической роли, исследования серотипового пейзажа и определения преобладающих генотипов Streptococcus pneumoniae у 459 детей, госпитализированных по поводу острого гнойного среднего отита, острого тонзиллита, внебольничной пневмонии, гнойного бактериального менингита
To study the etiological role, serotype distribution and prevalent Streptococcus pneumoniae genotypes in 459 children hospitalized with acute purulent otitis media, acute tonsillitis, community-acquired pneumonia, and purulent bacterial meningitis
From 70.6% to 88.2% of S. pneumoniae serotypes isolated from patients corresponded to «vaccine»-types

Summary

ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

Цель: выявление этиологической роли, исследования серотипового пейзажа и определения преобладающих генотипов (сиквенс-типов) Streptococcus pneumoniae у 459 детей, госпитализированных по поводу острого гнойного среднего отита, острого тонзиллита, внебольничной пневмонии, гнойного бактериального менингита. Материалы и методы: Использовался культуральный (бактериологический) метод, молекулярные методы (ПЦР, секвенирование). Статистическая обработка проводилась с помощью программ Microsoft Excel 2007 и Statistica 6.0. Результаты: S. pneumoniae был выявлен в 16,8% случаев. Преобладали серотипы 19F (39,7%) и 19A (13,2%), относящиеся к мультирезистентному клональному комплексу 320. С меньшей частотой (8,82%) встречались пневмококки 6 серогруппы (6АВ) — представители клонального комплекса 315, характеризующиеся устойчивостью к макролидам, клиндамицину и тетрациклину. Ключевые слова: Streptococcus pneumoniae, пневмококк, этиологическая роль, серотипы у детей, сиквенс-типы, резистентность. Etiological role and molecular-genetic features of Streptococcus pneumoniae in children’s infectious diseases.

Objective

Материалы и методы исследования

Mycoplasma pneumoniae

Findings

Результаты и их обсуждение