Abstract
O objetivo deste trabalho foi selecionar coeficientes de similaridade para serem aplicados a conjuntos de genótipos de algodoeiro com baixa diversidade genética. Analisou-se um conjunto de 65 linhagens e 4 cultivares de algodão, com marcadores de RAPD e SSR, e estimou-se a similaridade genética de acordo com sete coeficientes de similaridade: Coincidência Simples, Rogers & Tanimoto, Ochiai, Hamman, Jaccard, Dice e Russel & Rao. A adequação dos coeficientes ao conjunto de genótipos foi verificada por correlação entre as matrizes de distância, índice de consenso entre os dendrogramas e otimização de Tocher. As análises mostraram que o coeficiente de Russel e Rao foi divergente em relação aos demais e seu uso não é recomendável. Entre os parâmetros usados para avaliar a qualidade de informação de cada coeficiente, apenas o índice de consenso estabeleceu diferenças e os classificou em dois grupos: aquele em que a ausência simultânea é considerada e aquele em que ela é desconsiderada. Considerando-se a presença de apenas dois alelos microssatélites por loco e os maiores índices de consenso, os coeficientes de Coincidência Simples, Hamman e Rogers & Tanimoto devem ser preferidos, quando em conjuntos de genótipos de algodoeiro melhorados e com baixa diversidade.
Highlights
A expansão da cotonicultura para o Centro Oeste pode, em grande parte, ser atribuída ao melhoramento genético
A comparação entre os diferentes coeficientes de similaridade foi realizada por meio da correlação entre as distâncias originais e as distâncias obtidas pela dispersão bidimensional, pelo grau de distorção e pelo valor de estresse
A aplicação do método de otimização de Tocher ao agrupamento dos genótipos resultou na formação de 35 grupos idênticos, para seis coeficientes de similaridade, e de apenas dois grupos para o coeficiente de Russel & Rao (Tabela 5)
Summary
Foi analisado um conjunto de 69 genótipos de algodoeiro herbáceo, constituído por 4 cultivares e 65 linhagens endogâmicas (Tabela 1), todos desenvolvidos pelo Programa de Melhoramento da Embrapa Algodão, que utilizou o método genealógico. A matriz binária foi empregada para se estimar a similaridade genética entre cada par de genótipos, tendo sido empregados sete coeficientes de similaridade: Coincidência Simples, Rogers & Tanimoto, Ochiai, Hamman, Jaccard, Dice (Nei & Li) e Russel & Rao. As análises de agrupamento dos genótipos para cada coeficiente foram obtidas a partir do método de média aritmética não ponderada (“unweighted pair group method with arithmetic mean” – UPGMA) pelo programa NTSYS (“Numerical Taxonomy and Multivariate System”) versão 2.0 (Rohlf, 1992). A comparação entre as matrizes de similaridade, estimada para cada coeficiente de similaridade, foi feita com o módulo MAXCOMP do programa NTSYS-pc. A comparação entre os diferentes coeficientes de similaridade foi realizada por meio da correlação entre as distâncias originais e as distâncias obtidas pela dispersão bidimensional, pelo grau de distorção e pelo valor de estresse. A qualidade do ajuste entre a distância genética original e a obtida na projeção gráfica do dendrograma é estimada pelo parâmetro estresse, considerado insatisfatório, regular, bom, excelente e perfeito, quando os valores de estresse são 40, 20, 10, 5 e 0%, respectivamente (Kruskal, 1964; Meyer et al, 2004)
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