Determination of acidic dissociation constants of L-phenylalanyl-glycine and L-alanyl-L-alanine in water using ab initio methods

Abstract

A sidik ayrisma sabiti organik bilesiklerin en temel ozelliklerinden birisidir. Bu calismada, yogunluk fonksiyon teori DFT hesaplamalari 6-31+G d ile B3LYP birlestirilmis temel setler L-fenilalanil-glisin ve L-alanil-Lalaninin asidik ayrisma sabitlerinin belirlenmesinde uygulanmistir. L-fenilalanil-glisin ve L-alanil-L-alaninin sulufaz pK degeri hesaplamalari icin ab initio yontemi sunulmustur. Mevcut turler ve su arasinda olusan molekuller arasi hidrojen baglarinin olusumu Tomasi yontemi kullanilarak analiz edilmistir. Bu sekilde, su molekulleri ile solvate olmus L-fenilalanil-glisin ve L-alanil-L-alaninin katyonu, anyon ve notr turleri bazik sulu cozeltilerde belirlenmistir. Ayrica, bu dipeptidlerin pKa degerleri arasindaki iliski teorik olarak incelenmis ve kiyaslanabilir uyumlu deneysel sonuclar bulunmustur