Abstract

La organización de los sistemas agrícolas requiere la verificación de la identidad y pureza genética de los cultivares. El aumento en el número de cultivares de soja a ser evaluados y su estrecha base genética dificulta su identificación mediante evaluación de descriptores fenotípicos. La Unión Internacional para la Protección de las Obtenciones Vegetales (UPOV) ha reconocido la utilidad de marcadores moleculares asociados con caracteres fenotípicos descriptivos. Con el objetivo de desarrollar ese tipo de marcadores, se seleccionaron in silico seis SSR génicos o genómicos (Sat286, Satt229, GmPrx1, GMES1173, Satt571 y GmHi), más dos marcadores previamente reportados (GmF35H y SoyF3H). Todos fueron evaluados en 35 cultivares de soja. Los SSR seleccionados para peroxidasa en testa y color de hilo (GmPrx1 y GmHi) fueron monomórficos. El contenido de información polimórfica (PIC) promedio del conjunto de marcadores polimórficos fue 0,48, con una media de 3,12 alelos por locus. GmF35H discriminó las variedades de acuerdo al color de flor (blanca y violeta). El análisis discriminante determinó alto porcentaje de clasificación correcta para el carácter hábito de crecimiento (95,8%) y color de pubescencia (80,6%), utilizando Sat286 y SoyF3H respectivamente. Los valores de clasificación para color de vaina (74,2%) y tamaño de folíolo (73,5%) fueron intermedios, utilizando GMES1173 y Satt571 respectivamente. El marcador Satt229 no resultó discriminante para ciclo a floración (50%) y maduración (42,8%). Los marcadores moleculares seleccionados dentro o cercanos a secuencias de interés pueden ser integrados a un sistema de identificación genética de variedades de soja como complemento a los descriptores fenotípicos clásicos.

Highlights

  • The organization of agricultural systems requires the verification of the genetic identity and purity of cultivars

  • Discrimination tests showed a high percentage of accurate classification of growth habit (95.8%) and pubescence color (80.6%) with Sat286 and SoyF3H, respectively

  • Utilizando bases de datos de secuencias expresadas (ESTs) y datos de mapeo de QTLs, se podrían identificar genes relacionados a caracteres de interés, utilizando el escaneo de las secuencias de genes, ESTs y clones de ADNc para la búsqueda y cribado de microsatélites génicos in silico (Varshney et al, 2005c)

Read more

Summary

Summary

The organization of agricultural systems requires the verification of the genetic identity and purity of cultivars. Numerosos sistemas de marcadores moleculares han sido evaluados como herramientas aplicables para la identificación de variedades en soja (Diwan y Cregan, 1997; Song et al, 1999; Priolli et al, 2002; Giancola et al, 2002). Utilizando bases de datos de secuencias expresadas (ESTs) y datos de mapeo de QTLs, se podrían identificar genes relacionados a caracteres de interés, utilizando el escaneo de las secuencias de genes, ESTs y clones de ADNc para la búsqueda y cribado de microsatélites génicos in silico (Varshney et al, 2005c). El objetivo del presente trabajo es determinar la asociación existente entre un conjunto de marcadores moleculares (génicos y genómicos) y caracteres fenotípicos de interés descriptivo, que permitan la discriminación de un grupo de 35 variedades de soja utilizadas en Uruguay. Para ello se utilizaron un conjunto de SSR y un marcador alelo específico, localizados dentro de QTLs de interés

Variedades y caracteres fenotípicos seleccionados
Selección de marcadores
Extracción de ADN vegetal
Amplificación y detección de polimorfismos
Producto asociado
Análisis de datos
Selección y desarrollo de marcadores asociados a caracteres fenotípicos
Evaluación de marcadores
NoNmobmrebre mmaracracdaodror Tipo Tipo
Findings
Análisis de asociación

Talk to us

Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have

Schedule a call

Disclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.