Denizli ve Gerze Yerli Tavuk Irklarında TVB Lokusundaki Polimorfizmlerin Araştırılması

Abstract

Avian leukosis virusleri (ALV), tavuklarda tümör oluşturan retrovirüslerdir ve bu virüslere karşı henüz bir aşı gelişti-rilememiştir. Tümor viral B (TVB) lokusu ALV üç alt grubunun viral girişine ortam sağlayan, engelleyen veya aracı olan gruplara özgü yüzey reseptörlerini kodlar. Bu lokusun 172. ve 184. bazlarında iki adet tek nükleotit polimorfizmleri TVB*S1, TVB*S3 ve TVB*R allellerinin ayırt edilmesine imkân sağlar. TVB*S1; ALVB, ALVD ve ALVE üç alt viral girişi-ni destekleyen reseptörleri kodlar. TVB*S3; ALVB ve ALVD alt gruplarının hücreye viral girişini sağlayan reseptörleri kodlar. TVB*R'nin kodladığı reseptör ise ALVB, ALVD ve ALVE alt gruplarının hücreye viral girişini engeller. Yapılan bu çalışmanın amacı, Türkiye yerli tavuk ırkları olan Denizli ve Gerze tavuklarında bazı ALV alttiplerine karşı dirençlilik gösteren TVB*R’ allelinin varlığı ve TVB*S' allelli ile olası mutasyonlar DNA dizi analizi yöntemi kullanılarak araştırmak-tır. Tarım ve Orman Bakanlığı, Denizli İli, Denizli Horozu Üretme İstasyonu’nda yetiştirilen, Denizli ırkına ait dört varye-teden 148 ve Gerze İlçe Müdürlüğü’ne ait kümeste yetiştirilen, Gerze tavuklarından 27 olmak üzere toplam 175 tavuğa ait kan örnekleri materyal olarak kullanılmıştır. Tavuk kan örneklerinden gDNA izole edilmiştir. 175 örnek içinden iki örneğin TVB*S1/R, üç örneğin TVB*S1/S3, dört örneğin ise TVB*S1/S’ genotipte olduğu, diğerlerinin TVB*S1/S1 geno-tipinde olduğu tespit edilmiştir. Denizli ve Gerze popülasyonlarında tespit edilen TVB allellerinin frekansları sırasıyla TVB*S1 için 0.9730, 0.9815 ve TVB*R için 0.0034, 0.0185 olarak hesaplanmıştır. Gerze popülasyonunda TVB*S3 ve TVB*S’ allellerinin bulunmadığı, Denizli popülasyonunda bulunan TVB*S3 ve TVB*S’ allellerinin frekansları ise sırasıyla 0.0101 ve 0.0135 olarak hesaplanmıştır.