Abstract
Designed is a multi-locus PCR test-system that allows for differentiation between genetically altered Vibrio cholerae strains, biovar El Tor, with high and low epidemic potential respectively, based on identification of genetic marker structure in the agent of the seventh cholera pandemic - pandemicity island VSP-II. In the course of investigations selected have been three target genes allocated in the central region and terminal end of the mobile genetic element. This test-system offers the possibility to identify the strains containing intact VSP-II, the ones containing VSP-II with a short-length deletion, and the strains with VSP-II with extended deletion. The first two are classified as the variants with low epidemic potential, while the last ones - as the variants with high epidemic potential. Specificity and efficacy of the test-system is shown by the experiments with 28 toxigenic genetically altered V. cholerae strains, biovar El Tor, and 6 strains of closely related species and enterobacteria. The results obtained coincide with the data on mono-locus PCR assay and in a number of instances are verified by sequencing.
Highlights
Разработана мультилокусная ПЦР-тест-система, позволяющая дифференцировать токсигенные генетически измененные штаммы Vibrio cholerae биовара Эль Тор на штаммы с высоким и низким эпидемическим потенциалом на основе определения структуры одного из генетических маркеров возбудителя 7-й пандемии холеры – острова пандемичности VSP-II
Designed is a multi-locus PCR test-system that allows for differentiation between genetically altered Vibrio cholerae strains, biovar El Tor, with high and low epidemic potential respectively, based on identification of genetic marker structure in the agent of the seventh cholera pandemic – pandemicity island VSP-II
Specificity and efficacy of the test-system is shown by the experiments with 28 toxigenic genetically altered V. cholerae strains, biovar El Tor, and 6 strains of closely related species and enterobacteria
Summary
ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб», Саратов, Российская Федерация. Разработана мультилокусная ПЦР-тест-система, позволяющая дифференцировать токсигенные генетически измененные штаммы Vibrio cholerae биовара Эль Тор на штаммы с высоким и низким эпидемическим потенциалом на основе определения структуры одного из генетических маркеров возбудителя 7-й пандемии холеры – острова пандемичности VSP-II. Ключевые слова: Vibrio choleraе биовара Эль Тор, мультилокусная ПЦР-тест-система, дифференциация, эпидемический потенциал, остров пандемичности. К настоящему времени известно, что важную роль в широком распространении возбудителя холеры Эль Тор играют два острова пандемичности – VSP-I Остров пандемичности VSP-I состоит из 11 генов и является одним из наиболее стабильных генетических маркеров штаммов V. cholerae биовара Эль Тор. В данной области существует очевидная потребность в разработке информативного и быстрого способа, а также тест-системы для дифференциации токсигенных генетически измененных штаммов V. cholerae биовара Эль Тор по их эпидемическому потенциалу. Анализ и оценку результатов осуществляли путем сравнения полученных ПЦР-ампликонов с аналогичными фрагментами типичных штаммов V. cholerae
Sign-in/Register to view highlights & summary Sign-in/Register to access full text options 
Free) 
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Schedule a call
