Abstract
Under study was the microbiome structure in virgin light-colored hydromorphized solonetz soil by using molecular-genetic and cultural methods. It was shown that the diversity of the microbial community is constantly decreasing down the soil profile being sharply declined in the solonetz horizon. Against the background of decreasing the biodiversity some groups of Proteobacteria are prevailed in the solonetz horizon and in the lower part of the profile. An unusually higher share of Crenarchaeota (almost 20% of the community) is observed in the topsoil.
Highlights
Джаныбекский стационар расположен в северной части Прикаспийской низменности в пределах Волго-Уральского междуречья, на абсолютных отметках 25–28 м над ур. м
It was shown that the diversity of the microbial community is constantly decreasing down the soil profile being sharply declined in the solonetz horizon
Against the background of decreasing the biodiversity some groups of Proteobacteria are prevailed in the solonetz horizon
Summary
Джаныбекский стационар расположен в северной части Прикаспийской низменности в пределах Волго-Уральского междуречья, на абсолютных отметках 25–28 м над ур. м. Неоднородная окраска: палево-белесые зоны приурочены к верхней части плотных призмовидных структурных отдельностей, которые на изломе имеют кофейно-серый цвет. В нижней части появляются гипсовые прожилки и мелкие карбонатные пятна, которые распределены гнездами. Менее плотный и более свежий по сравнению с вышележащим горизонтом. Переход заметный по цвету и уменьшению количества солевых новообразований. Желтовато-бурый, более влажный и менее плотный, глыбистый, с редкими разбросанными округлыми стяжениями (диаметром до 1 см) из мелких кристаллов гипса, по отдельным ходам отчетливо видны солевые заполнения. Образцы для молекулярно-биологического анализа отбирали из средних частей генетических горизонтов, хранили при температуре –70°С. Обработку данных проводили при помощи программы QIIME (Caporaso et al, 2010). При расчете индексов разнообразия проводили нормализацию данных до 2165 сиквенсов на образец. Образцы для культурального исследования хранили при температуре +4°С. После инкубации от 3 до 14 дней (в зависимости от используемой питательной среды) проводили подсчет КОЕ (колониеобразующих единиц) с пересчетом на 1 г почвы
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Disclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.