Cloning and Expression of Sugarcane S -adenosylmethionine Synthetase Gene ScSAM

Abstract

利用RT-PCR和RACE技术从甘蔗品种新台糖22号（ROC 22）中克隆获得SAM基因的cDNA序列，命名为ScSAM，GenBank登录号为KC172558。用生物信息学方法预测分析其序列，cDNA全长1466 bp，含有1个1191 bp的完整开放阅读框（ORF），编码396个氨基酸，与高粱和玉米等植物的SAM蛋白有很高的相似性。系统进化树分析显示，甘蔗ScSAM与高粱的SAM蛋白亲缘关系较近。Real-time PCR分析表明ScSAM为组成型表达，在根中的表达量最高，是叶中表达量的3.6倍。其在黑穗病菌胁迫和低温（4℃）、聚乙二醇（PEG）、NaCl非生物胁迫下均被诱导表达，但表达模式不同；在H2O2胁迫下其表达被抑制。推测其可能参与甘蔗抗黑穗病过程，且在甘蔗抗寒、抗旱、抗盐和抗氧化等胁迫过程中也起某种作用。