Abstract
Objective of the study is to investigate biological properties of avian influenza virus strains that caused the outbreaks in Russia in 2016–2017. Materials and methods . The study was performed using advanced virological and molecular-biological methods in state-of-the-art equipment. Results and conclusion. In 2016, the outbreaks among wild birds and poultry caused by highly pathogenic avian influenza H5N8 virus have occurred in the territory of the Russian Federation. In May, 2016 an outbreak of H5N8 among wild birds was registered in the territory of the Republic of Tyva. In October-November, 2016 influenza virus H5N8 was isolated in the territory of the Republics of Tatarstan and Kalmykia, Krasnodar and Astrakhan Regions of Russia. In 2017 avian influenza H5N8 has become widespread in European part of Russia and caused multiple outbreaks among wild birds and poultry. Results of the investigations of the isolated strains show that all of them are highly pathogenic and belong to the clade 2.3.4.4. Molecular-genetic and virological analysis has revealed the differences between the viruses isolated in 2016–2017 and the virus of the same clade 2.3.4.4 that was isolated in 2014.
Highlights
Characterization of Avian Influenza H5N8 Virus Strains That Caused the Outbreaks in the Russian Federation in 2016–2017
Objective of the study is to investigate biological properties of avian influenza virus strains that caused the outbreaks in Russia in 2016–2017
In 2016, the outbreaks among wild birds and poultry caused by highly pathogenic avian influenza H5N8 virus have occurred in the territory of the Russian Federation
Summary
Биологический материал от птиц представлен мазками из клоаки и трахеи, а также фрагментами внутренних органов. Аллантоисная жидкость тестировалась на наличие вируса гриппа в реакции гемагглютинации с использованием 0,5 % суспензии эритроцитов петуха, а также методом ПЦР в реальном времени. Использовали референс-антигены и сыворотки хорьков, полученные от Dr R.Webby, St. Jude Children’s Research Hospital (Мемфис, США), а также сыворотки хорьков, полученные на штаммы вируса гриппа H5, ранее циркулировавшие в России. Выделение РНК из аллантоисной жидкости осуществлялось с помощью набора «АмплиПрайм РИБО-сорб» (ООО «НекстБио», Россия) согласно инструкции производителя. С целью получения первичной структуры генома вируса проведена ПЦР с использованием праймеров, специфичных к определенным участкам каждого гена, а также реакционной смеси DreamTaq PCR Master Mix (Thermo Scientific, США). Полногеномное секвенирование новых вирусов гриппа проведено по технологии Illumina с использованием MiSeq reagent kit v3 (Illumina, San Diego, США). Для определения вирулентности штаммов вируса гриппа использовали мышей линии Balb/c, самок, с массой тела 14–16 г, полученных из питомника ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор». Полученную сыворотку крови перед постановкой реакции торможения гемагглютинации в течение 18 ч обрабатывали RDE (receptor destroying enzyme) для удаления неспецифических термостабильных ингибиторов, затем прогревали на водяной бане при 56 °С для удаления неспецифических термолабильных ингибиторов
Sign-in/Register to view highlights & summary Sign-in/Register to access full text options 
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Schedule a call
