Caractérisation de la race bovine Somba à l’aide de marqueurs moléculaires

Abstract

Le polymorphisme de quatre catégories de marqueurs du génome — 11 systèmes de groupes sanguins, 5 locus des protéines du lait, 2 locus de protéines sanguines et 33 microsatellites, soit au total 51 locus — a été analysé dans quatre populations ou « races » bovines d’Afrique de l’Ouest : les races taurines Somba et Lagunaire, la population de zébus Peuls soudanais et la population Borgou, qui provient du métissage entre taurins et zébus, en vue de caractériser le polymorphisme de la race Somba et d’évaluer sa distance génétique avec les trois autres populations, notamment la race Lagunaire avec laquelle elle présente une forte ressemblance phénotypique. Quelles qu’aient été les catégories de marqueurs ou les méthodes utilisées, les quatre populations se sont séparées nettement les unes des autres. Au niveau des groupes sanguins, les différences les plus nettes ont été observées entre les taurins et les zébus, notamment dans les systèmes A, B et S. On a retrouvé par ailleurs chez les zébus la forte fréquence des allèles AlbS et HbB, ainsi que la prédominance bien connue de l’haplotype αs1-CnC, β-CnA2, κ-CnA qui contraste avec celle de l’haplotype αs1- CnB, β-CnA1, κ-CnB chez les taurins africains. Au niveau des microsatellites, l’analyse factorielle des correspondances a souligné le rôle discriminant de l’allèle ETH 225139, dont la fréquence a été très élevée chez la race Somba, et celui des allèles Hel 13182 et INRA 037114 qui ont paru spécifiques respectivement des zébus et de la race Lagunaire. Les fréquences de ces allèles dans la population Borgou ont été sensiblement intermédiaires entre celles des zébus et celles des taurins. Dans le cadre d’une démarche visant à établir dans quelle mesure la connaissance du génotype d’un animal aux 33 marqueurs microsatellites permettait d’identifier sa population d’origine, une proportion de 97 p. 100 d’animaux bien classés a été obtenue, les erreurs de classement s’étant limitées à des zébus incorrectement qualifiés de Borgou et vice versa.