Abstract
O objetivo deste trabalho foi estabelecer padrões alélicos e estimar as distâncias genéticas baseadas em marcador SSR de 44 cultivares de cebola adaptadas às condições de cultivo tropicais e subtropicais do Brasil. Para visualização da similaridade genética, utilizou-se o dendrograma UPGMA gerado da matriz de distâncias do coeficiente de Jaccard, com base em 40 alelos de 13 locos SSR. O DNA total foi extraído pelo método CTAB 2x, e os produtos de PCR foram analisados em géis de poliacrilamida desnaturante 6% e corados com nitrato de prata. O número de pares de bases foi estimado pelo método da mobilidade inversa, com base em regressão de produtos de tamanho conhecido. A média da heterozigosidade dos locos SSR foi 0,58. Os 40 alelos dos 13 locos SSR foram suficientes para distinguir as 44 cultivares de cebola. O maior número de alelos em comum foi observado entre as cultivares Yellow Granex e Henry's Special PRR e o menor, entre as cultivares Baia Periforme Super Precoce e Excel. Os sete grupos principais de cultivares identificados no dendrograma apresentaram concordância com a genealogia conhecida e o tipo agronômico das cultivares avaliadas. Os locos SSR selecionados são adequados para melhoramento e proteção de cultivares da espécie.
Highlights
Molecular characterization of onion cultivars using microsatellite markers Abstract – The objective of this work was to establish allelic patterns and to estimate genetic distances based on the SSR marker in 44 onion cultivars adapted to Brazil’s tropical and subtropical growing conditions
Total DNA was extracted according to the CTAB 2x protocol, and the PCR products were analyzed in 6% denaturing polyacrylamide gels and stained with silver nitrate
The seven main groups of onion cultivars identified in the dendrogram were in agreement with the known genetic genealogy and with the agronomic type of the analyzed cultivars
Summary
Carlos Antonio Fernandes Santos(1), Valter Rodrigues Oliveira(2), Marciene Amorim Rodrigues(1) e Hugo Leonardo Coelho Ribeiro(1). Resumo – O objetivo deste trabalho foi estabelecer padrões alélicos e estimar as distâncias genéticas baseadas em marcador SSR de 44 cultivares de cebola adaptadas às condições de cultivo tropicais e subtropicais do Brasil. A aplicação de SSR para estudos de diversidade genética ou de apoio à proteção de cultivares de cebola foi reportada por Fischer & Bachmann (2000), Jakse et al (2005) e Mahajan et al (2009). O objetivo deste trabalho foi estabelecer padrões alélicos e estimar as distâncias genéticas baseadas em marcador SSR para 44 cultivares de cebola adaptadas às condições de cultivo tropicais e subtropicais do Brasil, de forma a gerar um banco de dados de referência de apoio à proteção de cultivares e a programas de melhoramento da espécie para o país
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