Abstract

Adli bilimlerde SNP (Single nucleotide polymorphism, tek nükleotid polimorfizm) markırları kimliklendirmede, fenotip belirlemede, nesep ve soy tayininde kullanılmaktadır. Biyocoğrafik soy tahmininde farklı coğrafik bölgelerde bulunan popülasyonlar arasındaki farklılıkları gösteren soy SNP markırları (AISNPs, Ancestry Informative SNP Markers) kullanılmaktadır. AISNP markırları ile bir kişinin biyocoğrafik orijini ve her biyocoğrafik bölgeden alınan genetik soy yüzdesi tespit edilebilir. Bu bilgiler adli bilimlerde bilinmeyen bir şüphelinin, felaket kurbanlarının veya kayıp kişilerin kimliklendirilmesinde kullanılabilir. Bu makalede biyocoğrafik soy kavramı, biyocoğrafik soy tahmininde kullanılan AISNPs panelleri, uygulama yöntemleri, kullanılan istatistiksel yöntemler ve güncel adli uygulamalar tartışılmıştır.

Highlights

  • In forensic applications SNP (Single nucleotide polymorphism) markers are used for identification, determination of phenotypes, lineage and ancestry

  • The authors declare that they have no conflict of interests regarding content of this article

  • Daniel R, Santos C, Phillips C, Fondevila M, van Oorschot RA, Carracedo A, et al A SNaPshot of generation sequencing for forensic SNP analysis

Read more

Summary

55 AISNPs panel

Phillips ve ark. 2007, Fondevila ve ark. 2013 [18, 22] Kosoy ve ark. 2009 [21] Bulbul ve ark. 2011, 2016 [17, 30] Phillips ve ark. 2013 [20] Kidd ve ark. [19] Phillps et al 2014 [25]. Söz konusu çalışmada biyocoğrafik soy tahmininde 28 farklı (Avrupa, Afrika, Uzak Doğu, Merkez Güney Asya, Ortadoğu popülasyonları) popülasyon (Ntoplam=1081) ile üç farklı AIM SNP seti (33plex, 34-plex ve Eurasiaplex) çalışılarak popülasyonlar arası genetik ilişkiler belirlenmiştir. 33plex ile Avrupa, Uzak Doğu ve Afrika kıtalarına ait popülasyonları başarıyla ayrılabilirken, Ortadoğu/Merkez Güney Asya popülasyonlarının birbirlerinden ayrımı kesin olarak yapılamamıştır. Yine Türkiye popülasyonuna ait yapılan diğer bir araştırmada, Truelsen ve ark. Bu çalışmada yukarıda belirtildiği gibi kıtasal popülasyonların ayrımında kullanılan AISNPs bölgeleri (Kidd 55 AISNPs ve Seldin 128 AISNPs paneli) kullanılmış ve dünya popülasyonları ile karşılaştırma yapılarak, test edilen Türk popülasyonu İran ve diğer Avrupa ve Merkez Güney Asya popülasyonlarından ayrılamamıştır. Yapılan güncel bir çalışmada ise Kidd 55 AISNPs’de yer alan bölgelere ek olarak yine Uzak Batı Asya ve Akdeniz popülasyonlarının diğer popülasyonlarıdan ayrımında kullanılacak yeni 86 AISNPs markırları belirlenmiştir. Bu araştırmada da iki basamaklı biyocoğrafik soy tahmin yöntemi kullanılmış ve diğer çalışmalardan farklı olarak Güneybatı Asya, Kuzey Asya ve Uzak Doğu olarak Asya popülasyonları üç farklı gruba ayrılabilmiştir [39]

SNP Analiz Yöntemleri
86 AISNPs paneli 39 referans popülasyon ile test edilmiştir
Biyocoğrafik Soy Tahmininde Kullanılan İstatistiksel Yöntemler
Full Text
Published version (Free)

Talk to us

Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have

Schedule a call