Balon Balığı (Fugu rubripes)‘nda Katalaz Geninin Biyoinformatik Analizleri

Abstract

Bu çalışmada sucul bir model organizma olan balon balığı (Fugu rubripes) katalaz (cat) geninin biyoinformatik analizleri yapılmıştır. Moleküler biyoloji bilimi, son yıllarda biyoinformatik bilimine verilen önemin artmasına paralel olarak hızla gelişme göstermektedir. Her geçen gün artan genetik verilerin, saklanmasını, depolanmasını, organizasyonunu ve paylaşılmasını kolaylaylaştıran ve online genom veri tabanları ile istatistik bilimini kullanarak canlı organizmalardaki genlerin etkin şekilde tanımlanmasını ve karakterizasyonunu sağlayan biyoinformatik temelli olan bu çalışmada balon balığı katalaz geninin dizi bilgileri, diğer canlılarla olan filogenetik ilişkisi ve bu ilişkinin yüzde olarak ifade edildiği özdeşlik- benzerlik oranları tespit edilmiş, yine biyoinformatik çalışmalar için büyük önem arz eden korunmuş gen sintenisi dizayn edilmiştir. Tüm bu çalışmalar için NCBI-GenBank, EMBL, ENSEML ve UNIPROT veri tabanları kullanılmıştır. Tüm bu vei tabanlarından ulaşılan verileri değerlendirmek ve analizleri gerçekleştirmek için, Bioedit ve Mega programlarından yararlanılmıştır. Balon balığı cat genin tanımlanması, genin ekson ve intronlarından oluşan yapısı, filogenetik ağaç ve gen sintenisi gibi in-siliko analizler bu çalışmada tamalanmış ve tablo ve şekiller ile sunulmuştur.