Analisis Keragaman Gen Laktoferin Pada Sapi Friesian-Holstein Dengan Metode Pcr-Rflp

Elmy Mariana

doi:10.17969/agripet.v11i1.649

Abstract

Polymorphism analysis of lactoferrin gene on holstein-friesian cow with PCR-RFLP methodABSTRACT. The purposes of this study were to identify the polymorphism of the lactoferrin gene in Holstein-Friesian (HF) cows. The study was conducted on 281 heads of HF lactating cows coming from dairy farmers in Lembang district. Investigation on variant genotypes of the lactoferrin gene used PCR-RFLP method. Genotyping of the lactoferrin gene with EcoRI restriction enzyme produced two genotypes, i.e. AA (65.5%) and AB (34.5%) genotypes.

Highlights

The purposes of this study were to identify the polymorphism of the lactoferrin gene in Holstein-Friesian
The study was conducted on 281 heads of HF lactating cows coming from dairy farmers
Towards an integrated approach to study SNPs and expression of candidate genes associated with milk protein biosynthesis

Summary

MATERI DAN METODE

Sampel darah berasal dari 281sapi FH laktasi padatiga lokasi peternakan di daerah Lembang. Isolasi DNA dari sampel darah dilakukan dengan menggunakan metode ekstraksi phenol-chloroform (Sambrooketal, 1989) yang telah dimodifikasi untuk sampel darah yang disimpan dalam alkohol. DNA hasil ekstraksi digunakan untuk amplifikasi ruas gen target laktoferin sepanjang 301 pb. Amplifikasi in vitro dengan mesin thermal cycler dilakukan dengan kondisi denaturasi awal pada suhu 94 oC selama 5 menit, 35 siklus yang terdiri dari denaturasi. Fragmen gen hasil amplifikasi divisualisasikan pada gel agarose 1.5% dengan bufer 0,5x TBE (trisborat EDTA) yang dijalankan pada tegangan 100 v selama 40 menit dan diwarnai dengan etidiumbromida diatas UV trans ilmuninator. Menurut Nei (1987) Jika nii adalah individu yang bergenotipe AiAi, nij adalah individu yang bergenotipe AiAj, dan jumlah total sampel adalah n, maka frekuensi alel Ai (χi) dihitung dengan persamaan sebagai berikut:. Hasil penghitungan keragaman genetic diolah dengan Program statistic TFPGA Tools for Population Genetic Analysis (Miller, 1997)

HASIL DAN PEMBAHASAN

Frekuensi Genotipe dan Frekuensi Alel Gen Laktoferin

Pasar Kemis

DAFTAR PUSTAKA

Findings

Genetische Varianten des Bovine