Alt solunum yolu enfeksiyonu olan köpeklerde canine coronavirusun tespiti ve moleküler karakterizasyonu

Abstract

Coronaviridae familyasında yer alan coronaviruslar insan ve hayvanlarda sindirim ve solunum sistemi enfeksiyonlarına neden olmaktadır. Alfacoronavirus içerisinde yer alan canine coronaviruslar (CCoV)’ın CCoV I ve CCoV II olmak üzere iki alt tipi bulunmaktadır. CCoV-II ise CCoV- IIa ve IIb olmak üzere iki genotipe ayrılmaktadır. CCoV her yaştaki ve her türlü beslenme şekline sahip köpekleri etkilemesine rağmen özellikle yeni doğan yavrular daha duyarlı ve ciddi şekilde etkilenebilmektedir. Yapılan literatür araştırmalarına göre ülkemizde özellikle alt solunum yolu enfeksiyonlarındaki canine coronavirus varlığının tespitine yönelik moleküler çalışmalara rastlanılmamıştır. Bu çalışmada alt solunum yolu enfeksiyonu tanımlanan barınak köpeklerinde CCoV’un tespiti ve moleküler karakterizasyonunun yapılması amaçlandı. Bu amaçla alt solunum yolu enfeksiyonu tespit edilen 40 adet barınak köpeğinden alınan Bronkoalveolar Lavaj (BAL) sıvıları incelendi. Test edilen 40 köpeğe ait BAL sıvılarından 3 tanesinde CCoV tespit edildi. Yapılan dizin analizi sonrasında elde edilen dizinler ile filogenetik ağaç yapıldı. Filogenetik ağaçta pozitif bulunan 3 örnekten 2 sinin CCoV-I, bir örneğin ise CCoV-II olduğu tespit edildi. Sonuç olarak bu çalışma ile barınak köpeklerinin alt solunum yolu rahatsızlıklarında CCoV-I ve CCoV-II’ nin rol oynayabileceği ortaya konulmuştur. Ayrıca aynı barınakta farklı hayvanlarda iki farklı CCoV’nun tespiti önemli bir veri olarak değerlendirilmiş olup özellikle barınak koşulları gibi kalabalık ortamda barındırılan köpeklerdeki her iki tipin tespiti gelecekte oluşabilecek yeni varyantların ya da alt tiplerin oluşabilme ihtimalinin de göz ardı edilmemesi gerektiğini göstermektedir.