Abstract

5'-Dimethoxytrityl protection group of synthetic oligonucleotide stability in polymerase chain reaction

Highlights

  • Modification of 5ʹ-OH group of nucleic acids by substituents with various physicochemical properties is impor­tant for molecular biology

  • The synthesis of isopropylidene mRNA cap analogs modified with phosphorothioate moiety and their evaluation as promoters of mRNA translation / M

  • Purification of crude DNA oligonucleotides by solid-phase extraction and reversed-phase high-performance liquid chromatography / M

Read more

Summary

BIOORGANIC CHEMISTRY

Институт биоорганической химии Национальной академии наук Беларуси, Минск, Беларусь. Аннотация. Интересным представляется исследование симметричного и асимметричного замещения 5ʹ-гидроксила двуцепочечной ДНК (дцДНК) 4,4ʹ-диметокситритильной (ДМТ) группой. Симметричное замещение может позволить осуществлять селективное лигирование дцДНК в плазмидный вектор после ее сборки из олигонуклеотидов методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) по сравнению с побочными укороченными продуктами сборки. Чтобы провести подобные исследования необходимо выяснить, стабилен ли синтетический 5ʹ-ДМТ олигонуклеотид в условиях ПЦР. В данной работе методом высокоэффективной жидкостной хроматографии с УФ (260 нм) и масс-спектрометрической детекцией мы показали, что 5ʹ-ДМТ-группа стабильна в составе синтетического олигонуклеотида в условиях ПЦР, однако присутствие тиольных соединений может снижать выход 5ʹ-ДМТ-дцДНК. Мы планируем дальнейшее изучение влияния 5ʹ-ДМТ-группы в составе синтетических ДНК на функционирование различных ферментов. Ключевые слова: олигонуклеотиды, 4,4ʹ-диметокситритильная группа, ДМТ, полимеразная цепная реакция, ПЦР, синтетический ген. Стабильность 5ʹ-диметокситритильной защитной группы синтетического олигонуклеотида в условиях полимеразной цепной реакции / В. 5ʹ- DIMETHOXYTRITYL PROTECTION GROUP OF SYNTHETIC OLIGONUCLEOTIDE STABILITY IN POLYMERASE CHAIN REACTION

NEB NEB
Список использованных источников

Talk to us

Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have

Schedule a call

Disclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.