Abstract
5'-Dimethoxytrityl protection group of synthetic oligonucleotide stability in polymerase chain reaction
Highlights
Modification of 5ʹ-OH group of nucleic acids by substituents with various physicochemical properties is important for molecular biology
The synthesis of isopropylidene mRNA cap analogs modified with phosphorothioate moiety and their evaluation as promoters of mRNA translation / M
Purification of crude DNA oligonucleotides by solid-phase extraction and reversed-phase high-performance liquid chromatography / M
Summary
Институт биоорганической химии Национальной академии наук Беларуси, Минск, Беларусь. Аннотация. Интересным представляется исследование симметричного и асимметричного замещения 5ʹ-гидроксила двуцепочечной ДНК (дцДНК) 4,4ʹ-диметокситритильной (ДМТ) группой. Симметричное замещение может позволить осуществлять селективное лигирование дцДНК в плазмидный вектор после ее сборки из олигонуклеотидов методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) по сравнению с побочными укороченными продуктами сборки. Чтобы провести подобные исследования необходимо выяснить, стабилен ли синтетический 5ʹ-ДМТ олигонуклеотид в условиях ПЦР. В данной работе методом высокоэффективной жидкостной хроматографии с УФ (260 нм) и масс-спектрометрической детекцией мы показали, что 5ʹ-ДМТ-группа стабильна в составе синтетического олигонуклеотида в условиях ПЦР, однако присутствие тиольных соединений может снижать выход 5ʹ-ДМТ-дцДНК. Мы планируем дальнейшее изучение влияния 5ʹ-ДМТ-группы в составе синтетических ДНК на функционирование различных ферментов. Ключевые слова: олигонуклеотиды, 4,4ʹ-диметокситритильная группа, ДМТ, полимеразная цепная реакция, ПЦР, синтетический ген. Стабильность 5ʹ-диметокситритильной защитной группы синтетического олигонуклеотида в условиях полимеразной цепной реакции / В. 5ʹ- DIMETHOXYTRITYL PROTECTION GROUP OF SYNTHETIC OLIGONUCLEOTIDE STABILITY IN POLYMERASE CHAIN REACTION
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
More From: Proceedings of the National Academy of Sciences of Belarus, Chemical Series
Disclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.