Abstract
Flexible molecular docking studies for 5,7-dimethyl-6-phenylazo-3H-thiazolo[4,5-b]pyridin-2-ones have been performed with the purpose to reveal their potency as enzymes involved in the arachidonic acid (AA) cascade inhibitors: both cyclooxygenase isoforms (COX-1 and COX-2), and microsomal prostaglandin E synthase-1 (mPGES-1). The protein-ligand interaction fingerprint (PLIF) tool implemented in MOE software has been used for summarizing the interactions between ligands and the abovementioned enzymes. Receptor interaction fingerprints have been generated from the docked poses of the virtual screening hits with COX-1,2 and mPGES-1 active sites coordinates. 3D pharmacophore models containing two and three points queries as the combination of their structures steric and electronic parameters have been generated and it provides the affinity and inhibitory activity of the novel compounds towards multiply receptors. The analysis of the pharmacophore models obtained indicates the functionality of fused bicyclic thiazolopyridine scaffold which provides the steric placement of at least one of these heterocycles atoms in the respective pharmacophore centres. The fused thiazolo[4,5-b]pyridine-2-one system may be considered as a promosing scaffold for creating diverse combinatorial libraries of potential biologically active substances. The final conclusion has been confirmed by the results of the virtual screening procedures and pharmacophore centres modeling in molecules of novel thiazolo [4,5-b]pyridine-2-one.
Highlights
МОДЕЛИРОВАНИЕ 3D ФАРМАКОФОРОВ В МОЛЕКУЛАХ ПРОИЗВОДНЫХ 5,7-ДИМЕТИЛ-6-ФЕНИЛАЗО3Н-ТИАЗОЛО[4,5-b]ПИРИДИН-2-ОНА Е.В.Кленина, Т.И.Чабан, В.В.Огурцов, И.Г.Чабан, И.Я.Голос Ключевые слова: тиазоло[4,5-b]пиридин-2-оны; фармакофоры; виртуальный скрининг; докинг; докин говые «отпечатки пальцев» Проведены докинговые исследования, целью которых было установить возможность ингибирования производными 5,7-диметил-6-фенилазо-3Н-тиазоло[4,5-b]пиридин-2-она активности ферментов, которые являются катализаторами разных стадий циклооксигеназного пути метаболизма арахидоновой кислоты: обеих изоформ циклооксигеназы (COX-1, COX-2) и микросомной простанландин Е синтазы-1
Протизапальна активність ряду синтезованих сполук є нижчою порівняно з еталонними препаратами з показниками пригнічення запальної реакції в межах 12-39%
Найбільша кількість комплексів між активними конформаціями молекул досліджуваних речовин та mPGES-1 утворена за участі залишків амінокислот Arg73, His113, Tyr117, Arg126, Ser127, Tyr130 і Thr131 бічних ланцюгів рецептора
Summary
МОДЕЛИРОВАНИЕ 3D ФАРМАКОФОРОВ В МОЛЕКУЛАХ ПРОИЗВОДНЫХ 5,7-ДИМЕТИЛ-6-ФЕНИЛАЗО3Н-ТИАЗОЛО[4,5-b]ПИРИДИН-2-ОНА Е.В.Кленина, Т.И.Чабан, В.В.Огурцов, И.Г.Чабан, И.Я.Голос Ключевые слова: тиазоло[4,5-b]пиридин-2-оны; фармакофоры; виртуальный скрининг; докинг; докин говые «отпечатки пальцев» Проведены докинговые исследования, целью которых было установить возможность ингибирования производными 5,7-диметил-6-фенилазо-3Н-тиазоло[4,5-b]пиридин-2-она активности ферментов, которые являются катализаторами разных стадий циклооксигеназного пути метаболизма арахидоновой кислоты: обеих изоформ циклооксигеназы (COX-1, COX-2) и микросомной простанландин Е синтазы-1 (mPGES-1). Аналіз геометричного розташування молекул синтезованих речовин в активних центрах СОХ-1 і СОХ-2, типів зв’язування та залишків амінокислот бічних ланцюгів макромолекул пептидів, які утворюють зв’язки з лігандами, дозволяє встановити, що молекули всіх досліджуваних речовин утворюють комплекси з обома ізоформами СОХ за рахунок одного або декількох водневих зв’язків між Arg120 і Tyr355 та атомами молекул лігандів, що є Н-акцепторами (донорами електронної пари), причому у переважній більшості випадків одним із таких атомів є атом Нітрогену піридинового гетероциклу, хоча для декількох сполук утворення такого зв’язку відбувається за рахунок атомів Нітрогену фенілазогрупи або атомів Оксигену тіазолідинового гетероциклу і ацетамідного фрагмента
Sign-in/Register to view highlights & summary Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Schedule a callDisclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.
