Abstract
The distribution of Mycobacterium tuberculosis and scope of tuberculosis morbidity in the world are extremely considerable. Among regions with high burden of tuberculosis (according to the World Health Organization data for 2015) Mongolia is one of the most disadvantaged countries. This research was continuation of studying of phylogenetic structure of M. tuberculosis for the determination of evolutionary and migration processes in pathogen's northeastern population and was devoted to the study of the spatial distribution of epidemically significant genotypes and subtypes, circulating in central and border (northern and southern) Mongolia. The DNAs of 309 clinical isolates of the pathogen were genotyped by the 24-locus MIRU-VNTR and LSP methods. Strains of the Beijing lineage were additionally analyzed for the presence of specific SNPs and its 24-MIRU-VNTR profiles were compared with reference database of M. Merker et al. (2015). The study indicated significant predominance of strains of the Beijing lineage (subtype CC4). This genotype is characterized by high frequency of clustering, which indicates its epidemic danger and the relatively recent introduction of «successful» strains into the territory of Mongolia. Also, a relatively homogeneous distribution structure of genotypes and subtypes of the pathogen was revealed within the studied region, which differs from the structure of the Russian population of M. tuberculosis by its subtypical composition. Thus, we assuming that CC4-strains of the Beijing lineage spread into Mongolia from neighboring East Asian regions, most likely from the Northern provinces of China (Inner Mongolia) or nearest neighboring countries of Southeast Asia.
Highlights
Всемирное распространение Mycobacterium tuberculosis и масштабы заболеваемости туберкулёзом обусловливают важность эпидемиологических исследований возбудителя: бактериологических, физиологических, генетических, – и, кроме того, особенностей пространственной структуры групп микроорганизмов, отличающихся по патогенетическому потенциалу и филогенетическим дистанциям
The DNAs of 309 clinical isolates of the pathogen were genotyped by the 24-locus MIRU-VNTR and LSP methods
Strains of the Beijing lineage were analyzed for the presence of specific SNPs and its 24-MIRU-VNTR profiles were compared with reference database of M
Summary
ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека» 24а, Россия) 3 Национальный центр инфекционных болезней Всемирное распространение Mycobacterium tuberculosis и масштабы заболеваемости туберкулёзом обусловливают важность эпидемиологических исследований возбудителя: бактериологических, физиологических, генетических, – и, кроме того, особенностей пространственной структуры групп микроорганизмов, отличающихся по патогенетическому потенциалу и филогенетическим дистанциям. Данная работа посвящена изучению филогеографии эпидемически значимых генетических групп M. tuberculosis, циркулирующих в Монголии – регионе с высокой заболеваемостью туберкулёзом. По результатам исследования 309 штаммов возбудителя методами MIRU-VNTR типирования, LSP-типирования и субтипирования (сравнение результатов с референсными MIRU-VNTR профилями, выявление специфичных SNPs) в качестве доминирующего идентифицирован генотип Beijing (субтип CC4). В качестве возможного источника распространения штаммов субтипа CC4 генотипа Beijing на территорию Монголии предполагаются соседние Восточно-Азиатские регионы, наиболее вероятно – северные провинции Китая (Внутренняя Монголия) или ближайшие страны Юго-Восточной Азии. Ключевые слова: Mycobacterium tuberculosis, MIRU-VNTR, генотип Beijing, филогеография, генетическое разнообразие, туберкулёз в Монголии
Sign-in/Register to view highlights & summary Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Schedule a callDisclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.
