초위성체 DNA표지인자를 이용한 국내 육우집단의 품종특성 및 개체식별 체계설정

Abstract

소 품종 판별을 위해 DNA 마커 정보는 품종을 구별하거나, 형질을 구분하는데 있어 꾸준히 이용되고 있다. 본 연구에서는 Finnzymes (DIAGNOSTICS)사의 Bovine Genotypes Kit Ver1.1/2.1을 농촌진흥청 국립축산과학원이 보유한 호주산 및 미국산 수입우 DNA 샘플 148두/국내산 육우 DNA 샘플(Holstein) 170두와 정읍지역 한우 DNA 샘플 177두에 적용하여 한우품종 식별력을 분석 하였다. Bovine Genotype Kit 1.1은 11개의 ISAG MS 마커로 이루어져 있으며, 여기에 5개 MS 마커가 추가된 ver2.1 Kit를 사용하여 집단별 유전자형 데이타를 구축하였고, MS Tool kit 분석 및 Phylip program 분석을 수행하여 Phylogenetic tree를 작성하였고, Genotype 분석 프로그램인 GeneClass 2.0 (INRA/France)을 이용하여 품종 식별력을 추정하였다. 분석 결과 95% 이상의 정확성을 가진 한우 식별력은 100%로 나타났고, 호주산 수입우 95.3%, 국내산 육우는 90%의 높은 식별력을 각각 나타내었다. 따라서 Finnzymes 사의 상용화된 16종의 MS 마커는 한우집단의 유전적 특징을 객관적으로 구분하여 수입쇠고기/젖소고기/한우쇠고기에서 간편하게 한우개체 및 품종식별에 활용될 수 있는 가능성과 특히 국내에서 비육된 육우(젖소)를 수입산 쇠고기로부터 식별할 수 있는 장점이 있을 것으로 사료된다. DNA marker information is used to identify or distinguish cattle breeds or individual animal. The purpose of this study was to apply Bovine Genotypes Kit Version 1.1/2.1 to bovine DNA samples (National Institute of Animal Science) taken from Australian / American beef (n=148), Holstein beef (n=170) and Hanwoo cattle (n=177) bred in Jeongeub, Jeonbuk, Korea, so that it could distinguish Hanwoo breed. The Bovine Genotype Kits consist of 16 ISAG MS markers, which were used to build a database of genotypes in each group. Genotyping results were analyzed using MS Tool kit and Phylip program to create phylogenetic tree. The GeneClass 2.0 was used to estimate breed identification. These analyses found that this kit had 100% capacity to distinguish Hanwoo beef, 95.3% capacity to differentiate Australian / American beef and 90% capacity to identify Korean Holstein steer beef. Hence, it is expected that 16 commercial microsatellite markers is useful to categorizegenetic characteristics of Hanwoo breed and also identify Hanwoo individuals and the origin of beef. In particular, it is expected that these markers will be advantageous in discriminating domestic Holstein beef from Australian / Americanbeef.