Генетические варианты генов TCF4, LSM1, и CCDC60 ассоциированы с шизофренией

Abstract

Проведен анализ ассоциаций 30 однонуклеотидных полиморфизмов генов в группах больных шизофренией и контроле общей численностью 1020 образцов ДНК представителей русской популяции Сибирского региона. Для исследования были отобраны маркеры, показавшие ассоциацию с шизофренией или ее когнитивными эндофенотипами в широкогеномных ассоциативных исследованиях. Мультиплексное генотипирование проводилось на платформе «MassARRAY System 4». В результате проведенного анализа выявлены статистически значимые ассоциации, как для аллелей, так и для генотипов полиморфных вариантов генов TCF4, LSM1, CCDC60. Совокупность полученных данных указывает на то, что гены TCF4 и LSM1, вероятно, играют существенную роль в патогенезе шизофрении в популяциях мира. 1020 DNA samples of two groups of people (schizophrenia and control) from the Russian population were analyzed using 30 SNPs. As the analyzed markers, SNPs were selected that showed an association with schizophrenia or variability of cognitive abilities in genome-wide association studies. Multiplex genotyping was performed using the MassARRAY System 4 platform. As a result of the analysis, statistically significant associations were revealed for polymorphic variants of the TCF4, LSM1, CCDC60 genes. Our results confirm the role of the TCF4 and LSM1 genes in the schizophrenia pathogenesis in world populations.