Исследование комплексообразования акридинового красителя профлавина с дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатом 5-d(TpGpCpA) в водном растворе методом 1Н-ЯМР спектроскопии

R A Eaton ,S F Baranovsky,L N Djimant,S G Osetrov,David B Davies ,D A Veselkov ,A N Veselkov

doi:10.7124/bc.0004c3

R A Eaton , S F Baranovsky + Show 5 more

Open Access

https://doi.org/10.7124/bc.0004c3

Copy DOI

Abstract

Highlights

In aqueous salt solution has been studied by one- and two- dimentional 500
Different schemes of complexation of proflavine with the tetranucleotide have been analysed and the equilibrium constants, enthalpies AH, entropies AS of different reactions leading to the formation of 1:1, 1:2, 2:1, 2:2 complexes have been determined
It is concluded that proflavine intercalates preferentially to pyrimidine-purine TG- and CA-sites of the tetranucleotide sequence

Summary

Таблица I

В водном ность образования в растворе комплекса 2:2 проф лавина как с d(TGCA)-, так и с d(CGCG)-последо вательностью весьма велика [6], т. е. связывание второй молекулы красителя с дуплексом d(TGCA) так же выгодно, как и посадка одной молекулы в комплексе 1:2. Полученные в результате расчетов величины экранирования протонов профлавина в комплексе 1:2 фактически являются средними для двух возможных мест связывания красителя в пиримидин-пуриновые сайты дезокситетрануклеотида 5'-d(TGCA). Что же касается конформации дезоксирибозы тетрануклеотида d(TGCA), то в этом случае, так же как и при комплексообразовании тетрамера с бромистым этидием [8 ], из экспериментальных концентрационных зависимостей протонных хими ческих сдвигов нельзя сделать столь определенных выводов, как это возможно при нахождении взаим ной ориентации плоскостей ароматических основа ний и хромофора красителя в составе интеркалированного комплекса. Сравнение термодинамических параметров комплексообразования профлавина и фенантридинового красителя бромистого этидия с одноцепочечными тетрануклеотидными последовательностя ми [30] при одинаковых экспериментальных усло виях показывает, что образование комплексов 1:1 и 2:1 этих красителей с мономером тетрануклеоти да характеризуется несколько отличными значени ями энтальпии и энтропии. 1 H-NMR investigation of coraplexation of acridine dye proflavine with deoxytetraribonucleoside triphosphate 5'-d(TpGpCpA)

Summary

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ