Abstract

The objective of the study: to identify the frequency of various species of non-tuberculous mycobacteria (NTM) isolated in the patients of TB services in Siberian Region during 2014-2018, to determine the correlation between rates of resistance to different antibacterial drugs. Subjects and methods . PCR hybridization on strip strips (Hain Lifescience GenoType Mycobacterium CM / AS) was used to genotype 475 NTM isolates of patients from various TB hospitals inSiberia. Drug susceptibility was tested by minimum inhibitory concentrations (MIC) on culture with serial micro-dilutions in a liquid medium using TREK Diagnostic Systems kits. 64 panels were used for slow-growing mycobacteria (SLOWMYCO), 46 - for fast-growing ones(RAPMYCO). Data processing was performed using the APL of 3.5.1 and the data analysis software of Rstudio, version 1.1.442. Results of the study 1. Tomsk Region differs from the other considered regions ofSiberiadue to higher frequency of M. intracellulare among isolates identified by PCR hybridization. In other regions, M. fortuitum prevails among isolated. 2. Incomparison with the reference data (CLSI M62, 2018), differences in the MIC of some NTM species isolated from patients in Siberia and theFar Eastwere observed, most likely related to the regional characteristics of these isolates. 3. HTM isolates resistant to moxifloxacin are also resistant to linezolid, trimethoprim, and ciprofloxacin. 4. Fast-growing clarithromycin resistant HTM isolates are predominantly sensitive to moxifloxacin, ciprofloxacin, and trimethoprim.

Highlights

  • Original articlesВЫЯВЛЕНИЕ НЕТУБЕРКУЛЕЗНЫХ МИКОБАКТЕРИЙ, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ В РАЗНЫХ РЕГИОНАХ СИБИРИ, И АНАЛИЗ ИХ ЛЕКАРСТВЕННОЙ УСТОЙЧИВОСТИ.

  • Цель исследования: выявить частоту видов нетуберкулезных микобактерий (НТМ), выделенных от пациентов противотуберкулезных учреждений Сибирского региона за период 2014-2018 гг., определить корреляционные взаимосвязи между показателями резистентности к разным антибактериальным препаратам.

  • Методом ПЦР-гибридизации на стрип-полосках (Hain Lifescience GenoType Mycobacterium CM/AS) проведено генотипирование 475 изолятов НТМ, выделенных от пациентов разных противотуберкулезных стационаров Сибири.

Read more

Summary

Original articles

ВЫЯВЛЕНИЕ НЕТУБЕРКУЛЕЗНЫХ МИКОБАКТЕРИЙ, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ В РАЗНЫХ РЕГИОНАХ СИБИРИ, И АНАЛИЗ ИХ ЛЕКАРСТВЕННОЙ УСТОЙЧИВОСТИ. Цель исследования: выявить частоту видов нетуберкулезных микобактерий (НТМ), выделенных от пациентов противотуберкулезных учреждений Сибирского региона за период 2014-2018 гг., определить корреляционные взаимосвязи между показателями резистентности к разным антибактериальным препаратам. Методом ПЦР-гибридизации на стрип-полосках (Hain Lifescience GenoType Mycobacterium CM/AS) проведено генотипирование 475 изолятов НТМ, выделенных от пациентов разных противотуберкулезных стационаров Сибири. Лекарственную устойчивость тестировали методом минимальных ингибирующих концентраций (МИК), культуральным методом серийных микроразведений в жидкой питательной среде с применением наборов TREK Diagnostic Systems. Использовали 64 панели для медленнорастущих микобактерий (SLOWMYCO), 46 – для быстрорастущих (RAPMYCO). Обработку данных проводили с использованием языка программирования 3.5.1 и среды анализа данных Rstudio, версии 1.1.442

Результаты исследования
Материалы и методы
Статистическая обработка результатов исследования
Годы наблюдения
Вид микобактерий
Коэффициент корреляции Спирмена
Findings
Первая компонента
Full Text
Published version (Free)

Talk to us

Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have

Schedule a call