Электронная коллекция паразитов рыб Мирового океана Института морских биологических исследований им. А. О. Ковалевского

Abstract

Биологические коллекции — основа для таксономических исследований и изучения биологического разнообразия регионов. Задача настоящей работы — создание электронного каталога коллекционных образцов и таксономической базы данных (БД), а также развитие веб-ресурса для доступа к ним с целью интегрирования биологических коллекций в исследовательский процесс. Коллекция паразитов рыб Мирового океана ИМБИ РАН послужила материалом для создания сайта, который написан на PHP с использованием сценариев JavaScript и работает под управлением веб-сервера Apache. Управление БД осуществлено при помощи СУБД MySQL. Сайт marineparasites.org включает каталог коллекционных материалов, таксономическую базу данных и библиотеку публикаций о видах паразитов рыб. Интерфейс сайта обеспечивает доступ к перечисленным ресурсам. В основе функционирования сайта лежат четыре связанные друг с другом сущности: объект хранения, организмы, таксоны и публикации. Каждому понятию соответствует таблица базы данных. В процессе ввода система автоматически формирует связи между коллекционными экземплярами организмов, их типовым статусом и прочими атрибутами. Посетители сайта при помощи выборок и фильтров делают запросы и получают целостное представление о коллекции. Страница таксона состоит из данных о систематическом положении вида и его синонимах. На странице о виде-паразите расположен индикатор наличия экземпляров вида в коллекции, перечень атрибутов коллекционных экземпляров, публикации, где упоминается данный вид, типовой район и хозяин вида-паразита, а также другие места и хозяева находок, описания и изображения видов. Таким образом, пользователь планомерно переходит от описаний видов паразитов к их хозяевам, от коллекционных образцов — к изображениям и диагнозам видов, к публикациям и обратно. Сайт сделан англоязычным, что даёт возможность зарубежным и отечественным исследователям получить информацию о коллекции паразитов рыб Мирового океана ИМБИ РАН и интегрировать её в международные веб-ресурсы по биоразнообразию. Аудитория сайта — профессиональные исследователи паразитов, но заложенные идеи позволяют достроить сайт до виртуальной коллекции любых организмов или до веб-портала о разнообразии флоры и фауны любого региона. Сайт является результатом плодотворного взаимодействия биологов и программистов, способствует интенсификации обмена коллекционными данными и образцами и служит инструментом исследования паразитарной компоненты морских сообществ.