Estudos sobre o mesozooplâncton foram realizados no sistema estuarino de Barra das Jangadas, Pernambuco, Brasil (8º14'36"S, 34º56'28"W) visando analisar a estrutura da comunidade. As amostras foram obtidas com rede de plâncton, com malha de 300 µm, durante os períodos, seco (janeiro/2001) e chuvoso (julho/2001), nas marés de sizígia e de quadratura, em intervalos de três horas. Foram identificados 37 taxa, destacando-se Copepoda com as espécies Pseudodiaptomus acutus (F. Dahl, 1894), Pseudodiaptomus richardi (F. Dahl, 1894), Acartia lilljeborgi (Giesbrecht, 1892), Parvocalanus crassirostris (Dahl, 1894), Oithona hebes (Santos, 1973) e Notodiaptomus cearensis Wright, 1936. A densidade total durante o período seco variou de 69,34 a 8.568,34 org.m-3. Para o período chuvoso variou de 261,98 a 10.224,83 org.m-3. Os Crustacea meroplanctônicos (Brachyura zoea) foram muito freqüentes e muito abundantes, destacando seu importante papel na cadeia trófica pelágica. A diversidade específica durante o período seco, variou de 0,44 a 3,13 bits.ind-1, e para o período chuvoso de 0,66 a 2,93 bits.ind-1. Os baixos valores de diversidade ocorreram devido à dominância de Brachyura (zoea). A análise de agrupamento revelou a formação de dois grupos. O primeiro formado por espécies marinhas e euri-halinas, e o segundo por espécies indicadoras de ambientes estuarinos.
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