Mutational spectrum and its prognostic significance in childhood acute lymphoblastic leukemia based on next-generation sequencing technology

Abstract

目的分析儿童急性淋巴细胞白血病（ALL）的基因突变谱及其预后意义。方法回顾性分析2016年11月至2019年12月福建医科大学附属协和医院采用二代测序技术（NGS）行基因突变检测的141例初治ALL患儿的临床资料，分析基因突变谱及其对ALL患儿预后的影响。结果141例患儿中，83例（58.9％）检出体细胞突变，包括37个Ⅰ类及123个Ⅱ类突变位点。单核苷酸变异（SNV）为最常见的突变类型。KRAS（20/160，12.5％）为最常见的突变基因，其次为NOTCH1（11.9％）及NRAS（10.6％）。RAS通路（KRAS、FLT3、PTPN11）、PAX5及TP53突变仅在B-ALL患儿中检出，而FBXW7、PTEN突变仅在T-ALL患儿中检出；NRAS突变主要在B-ALL中检出，而NOTCH1突变主要在T-ALL中检出。每例T-ALL患儿检出的平均基因突变个数显著高于B-ALL患儿（4.16±1.33对2.04±0.92，P＝0.004）。按照有无遗传变异将患儿分为突变组和无突变组，两组的性别、年龄、初诊白细胞计数、微小残留病监测结果、预计3年无事件生存（EFS）率及总生存（OS）率差异均无统计学意义（P值均>0.05）；但突变组T-ALL以及融合基因阴性患儿的比例显著高于无突变组（P值分别为0.021和<0.001）。进一步亚组分析，在融合基因阴性的患儿中，有Ⅰ类突变的患儿预计3年EFS率显著低于无Ⅰ类突变的患儿（85.5％对100.0％，P＝0.039）；在B-ALL患儿中，伴TP53突变的患儿预计3年EFS率显著低于不伴有TP53突变的患儿（37.5％对91.2％，P<0.001）。结论体细胞突变在儿童ALL中较为常见，与临床表型及预后具有一定的相关性，NGS可作为传统MICM分型检查的重要补充。