Abstract

The blood coagulation system plays an important role in health and disease. It is a complex network of proteolytic reactions that is activated during injuries and controls the formation of a fibrin clot. Although new components and reactions have not been discovered for thirty years, during this time there has been a revolution in understanding of how this system works and what enzymes are the optimal targets for the therapy. At the same time, new methods of drug development, first of all, computer docking, which are ideally suited for the discovery of inhibitors of blood clotting enzymes, have appeared. In this review, an attempt has been made to correlate the lines of development of new ideas about the mechanisms of coagulation, new methods of searching for drugs and their combination, thanks to which now there are more and more potentially interesting molecules that can change the face of the anticoagulant therapy in the near future. In the review, molecular modeling methods, primarily docking, which are increasingly used at the initial stage of developing new drugs, the role of docking at the initial stage of developing new inhibitors are briefly considered and the structure of the active centers of factors Xa and XIa, which determines their interaction with inhibitors, are discussed in detail.

Highlights

  • Контактная информация: Пантелеев Михаил Александрович, д-р физ.-мат. наук, профессор, зав. лабораторией клеточного гемостаза и тромбоза НМИЦ детской гематологии, онкологии и иммунологии им

  • The blood coagulation system plays an important role in health and disease

  • New methods of drug development, first of all, computer docking, which are ideally suited for the discovery of inhibitors of blood clotting enzymes, have appeared

Read more

Summary

Структура активных центров факторов свертывания Xa и XIa

Докинг позволяет позиционировать лиганд-молекулу, рассматриваемую в качестве кандидата в ингибиторы, в активном центре белка-мишени, оценить ее характерные взаимодействия с белком и продумать стратегию модификации такой молекулы для увеличения ее ингибирующей активности. В литературе регулярно появляются публикации (например, [60]), которые показывают, что докинг стал действенным инструментом на начальной стадии разработки новых ингибиторов для заданных белков-мишеней. Вторая группа: оснóвные ингибиторы – соединения с активностью против фактора Ха (например, соединения на основе амидина), которые содержат оснóвные группы, заряжающиеся положительно при нейтральном pH. Механизм действия этих веществ заключается в их способности связываться с антитромбином III и изменять конформацию этого белка таким образом, что аффинитет антитромбина III к фактору Xa многократно увеличивается. Полисахаридные ингибиторы фактора Ха не являются прямыми ингибиторами данной мишени, однако благодаря клинической эффективности их до сих пор используют в медицине, например, при остром тромбозе глубоких вен.

Не влияет на активность тромбина It does not affect thrombin activity
Findings
Применение докинга на начальной стадии разработки ингибиторов

Talk to us

Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have

Schedule a call

Disclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.