Abstract
The article presents results of the molecular typing and phylogenetic analysis of N. Gonorrhoeae strains in the Russian Federation conducted based on a large sample of N. Gonorrhoeae strains. A considerable genetic variety of N. Gonorrhoeae strains circulating in the territory of the Russian Federation was revealed, which can serve as an evidence of a high rate of accumulation of por and tbp gene mutations among the Russian population of N. Gonorrhoeae strains. The authors established the genetic relationship between individual sequence types of N. Gonorrhoeae strains, and revealed total and dominating sequence types of N. Gonorrhoeae strains found both in different territories of the Russian Federation and abroad, which confirms that such strains can be transferred between different territories of the Russian Federation and from abroad due to active migration of population.
Highlights
Gonorrhoeae strains circulating in the territory of the Russian Federation was revealed, which can serve as an evidence of a high rate of accumulation of por and tbp gene mutations among the Russian population of N
Gonorrhoeae strains, and revealed total and dominating sequence types of N. Gonorrhoeae strains found both in different territories of the Russian Federation and abroad, which confirms that such strains can be transferred between different territories of the Russian Federation and from abroad due to active migration of population
Wong W.W., Huang C.T., Li L.H. et al Molecular epidemiological identification of Neisseria gonorrhoeae clonal clusters with distinct susceptibility profiles associated with specific groups at high risk of contracting human immunodeficiency virus and syphilis
Summary
Для оценки генетического разнообразия штаммов N. gonorrhoeae, циркулирующих на территории Российской Федерации, были проведены молекулярное типирование и филогенетический анализ 429 штаммов N. gonorrhoeae. Амплификация и секвенирование исследуемых генов (por и tbp) осуществлялись с использованием праймеров Условия амплификации генов por и tbp приведены в табл. 2. После определения нуклеотидных последовательностей генов por и tbp N. gonorrhoeae для них были назначены порядковые номера аллелей и сиквенстипы в международной базе данных NG-MAST. При полном совпадении нуклеотидной последовательности исследуемого гена с одним из имеющихся в базе данных аллелей ему присваивался номер данного аллеля. При несовпадении результатов секвенирования с имеющимися аллелями оригинальную хроматограмму секвенирования направляли в международную базу данных NG-MAST для присвоения номера новому аллелю. По полученной комбинации номеров аллелей генов por и tbp определяли сиквенс-тип штамма N. gonorrhoeae. В случае отсутствия в базе данных искомой комбинации аллелей данные направляли в международную базу NG-MAST для присвоения номера новому сиквенс-типу
Sign-in/Register to view highlights & summary Sign-in/Register to access full text options 
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Schedule a callDisclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.
