Estructuras tipo cremallera, conformaciones alternativas de ADN en regiones ricas en guanina y la importancia de los cationes para su estabilidad

Abstract

La fabricación de nanoestructuras a partir de biomoléculas como fibras de ADN es una frontera en continua exploración gracias a una multitud de aplicaciones potenciales en sistemas biológicos complejos. Las secuencias analizadas se encuentran en sistemas biológicos como en orígenes de replicación de virus y bacterias. En este artículo se reporta la caracterización detallada a nivel atómico de ADN rico en Guaninas que forman estructuras en cremallera. Para esto se utilizaron métodos de modelación con mecánica molecular. Se construyeron modelos para las estructuras y se minimizaron, lo cual permitió su análisis vía mecánica molecular para entender los factores que determinan la estructura más estable. Se encontró que la presencia de iones con carga positiva cercanos a la región rica en Gs de las secuencias estudiadas es de importancia fundamental en la estabilidad de estos ensambles de ADN. En resumen, los resultados permiten mejorar la comprensión de este sistema a escala molecular permitiendo desarrollar procedimientos más eficientes para el control de la fabricación de nanoestructuras en ADN en cremallera y encontrar sus aplicaciones en sistemas biológicos.