Abstract
Особенности процесса самоассоциации дезоксигексануклеотида 5'-d(GpCpApTpGpC) и его комплексообразования с антрациклиновым антибиотиком дауномицином в водном растворе
Highlights
При минимизации функционала невязки экспериментальных и расчетных значений химических сдвигов d(N0) исходные значения равновесной константы образования дуплекса KD и значения протонных химических сдвигов в мономерной и дуплексной формах гексамера d(GCATGC) брали из результатов анализа температурных зависимостей химических сдвигов
The self-association of self-complementary deoxyhexanucleotide 5'd(GpCpApTpGpC) and its complexation with antitumor antibiotic daunomycin have been investigated in aqueous solution using 1Dand 2D- H NMR correlation spectroscopy (2D-TOCSY and 2DNOESY)
Based on the analysis of the proton chemical shifts of the hexamer at small concentrations and at relatively low temperatures, it has been assumed that the hexamer d(GCATGC) forms a compact structure in aqueous solution
Summary
Особенности процесса самоассоциации дезоксигексануклеотида 5'-d(GpCpApTpGpC) и его комплексообразования с антрациклиновым антибиотиком дауномицином в водном растворе. Измерены концентрационные и температурные зависимости химических сдвигов необменивающихся протонов дезоксигексануклеотида и дауномицина, по которым рассчитаны равновесные константы и термодинамические параметры (АН и AS) реакций образования дуплекса d(GCATGC) и комплексов гексамера с антибиотиком. Проведен сравнительный анализ параметров образования комплексов антибиотика дауномицина с дезоксигексануклеотидами различной последовательности оснований в цепи. Для изученных нами самокомплементарных дезоксигексануклеотидов 5'-d(CpGpTpApCpG), 5'd(CpGpCpGpCpG) и 5'-d(TpApCpGpTpA) [28, 29] нарушения в структуре дуплекса проявляются в меньшей степени и, следовательно, специфичность к последовательности, структурные и термодина мические параметры комплексообразования оказы ваются более близкими к параметрам взаимодейст вия DAU с полимерной ДНК в водном растворе. В настоящей работе методами одномерной и двухмерной корреляционной ЯМР спектроскопии (500 МГц) изучена самоассоциация самокомпле ментарного дезоксигексануклеотида d(GpCpApTpGpC), имеющего инвертированную нуклеотидную последовательность по отношению к исследованно му ранее изомерному гексамеру d(CpGpTpApCpG) [28], и его комплексообразование с антибиотиком дауномицином в водно-солевом растворе.
Sign-in/Register to view highlights & summary Sign-in/Register to access full text options 
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Schedule a callDisclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.
