Неинвазивный пренатальный ДНК-скрининг - возможности и перспективы полногеномного подхода

Abstract

Неинвазивный пренатальный ДНК-скрининг (НИПС) начал использоваться в клинической практике в 2011г. и в настоящее время широко применяется, как и в мире, так и в России. Проанализирована встречаемость «редких» анеуплоидий при проведении полногеномного НИПС у 2061 пациенток и исходы беременностей при наличии таких результатов. Показано, что при анализе всего генома для полногеномного варианта НИПС можно получить дополнительную информацию, важную как для прогноза течения беременности, так и для прогноза плода. Это позволяет выделить дополнительную небольшую группу беременных, которым может быть рекомендовано более пристальное наблюдение в течение беременности или проведение дополнительных диагностических процедур. Однако для определения чувствительности и специфичности определения «редких» анеуплодий и CNV в настоящий момент недостаточно данных. Noninvasive prenatal DNA screening (NIPS) is getting more widespread in clinical practice in Russia and all around the world. The use of shallow whole-genome sequencing for NIPS allows analysis of all chromosome aneuploidies; hence there are large-scale studies only on test performance on common trisomies. This study aimed to analyze the prevalence of «rare» aneuploidies using whole-genome NIPS and pregnancy outcomes in case of a high risk of «rare» aneuploidy. Noninvasive prenatal DNA screening was performed using in house developed protocol. We have analyzed 2061 samples. In 8 cases (0.4%) high-risk of rare trisomy was detected (3 - trisomy 7, 2 - trisomy 8, 1 - trisomy 10, 2 - trisomy 15). We have identified two cases of a high risk of large copy number variations (CNV). For all of the high-risk cases, we have information about pregnancy outcomes. Thereby whole-genome analysis will enable us to get the additional information and reveal pregnancies in need of further observation or testing. Hence there is not enough data for the estimation of sensitivity and specificity of detection of «rare» aneuploidies.